[发明专利]用于预测乳腺癌患者的化疗有效性的方法

说明书

本发明涉及一种用于预测乳腺癌患者化疗有效性的方法，更具体地，涉及一种方法，其在从乳腺癌患者获得的生物样品中测量乳腺癌的预后预测基因和标准化基因的表达水平、将测量结果归一化、并将患者分类为预测具有高化疗有效性的人群和预测具有低化疗有效性的人群。本发明的方法允许准确预测乳腺癌患者的化疗有效性，并且可以有效地用于提示针对未来乳腺癌治疗方向的线索的目的。

技术领域

本申请要求于2016年11月23日提交的韩国专利申请No.10-2016-0156824的优先权，所述韩国专利申请的全部内容通过引用并入本文。

本发明涉及一种预测乳腺癌患者化疗有效性的方法，更特别地涉及一种预测乳腺癌患者化疗有效性的方法，该方法包括：步骤a：在从所述乳腺癌患者获得的生物样品中测量选自由UBE2C(泛素缀合酶E2C)、TOP2A(拓扑异构酶2α)、RRM2(核糖核苷酸还原酶M2)、FOXM1(叉头框M1)和MKI67(增殖标志物Ki-67)组成的组中的至少一种增殖相关基因、以及BTN3A2(嗜乳脂蛋白亚家族3成员A2)免疫相关基因的mRNA表达水平；步骤b：将所述步骤a中测量的所述mRNA表达水平归一化；和步骤c：通过所述步骤b中归一化的所述至少一种增殖相关基因和所述免疫相关基因的组合来预测所述乳腺癌患者的化疗有效性，其中当所述增殖相关基因过表达时预测所述化疗有效性为高以及当所述免疫相关基因过表达时预测所述化疗有效性为低。

背景技术

乳腺癌是女性最常见的癌症，也是第二大致死癌症。2001年，乳腺癌患病率美国为每100,000人中90-100人，欧洲为每100,000人中50-70人。该病的发病在世界范围内不断增加。乳腺癌的风险因素包括种族、年龄、抑癌基因BRCA-1、BRCA-2和p53中的突变。饮酒、高脂肪饮食、缺乏运动、绝经后的外源性激素和电离辐射也会增加乳腺癌的风险。在雌激素受体和孕激素受体阴性乳腺癌(分别为ER-和PR-)、大肿瘤大小、高级别细胞学诊断结果以及年龄35岁以下的人中乳腺癌预后更差(Goldhirsch等人.(2001).J.Clin.Oncol.19：3817-27)。估计2005年将诊断出约212,000例新的浸润性乳腺癌病例和58,000例新的非浸润性乳腺癌病例，预计2005年有40,000名女性死于乳腺癌。

手术后，目前治疗乳腺癌的方法需要附加的辅助治疗来减少将来的复发，例如化学疗法、抗激素疗法、靶向疗法或放射疗法。其中，化学疗法是抗癌疗法之一。取决于癌症的状况、肿瘤的大小、肿瘤的病理阶段或其他因素，乳腺癌患者的病理状态因患者而异。因此，由于乳腺癌患者的不同病理状况和不同反应，一些患者可能受益于抗癌药物的化疗，但其他患者可能不会。对化疗效果不佳的患者连续施用化疗可能会增加副作用并对患者造成不必要的疼痛。

在这方面，在向乳腺癌患者施用抗癌药物之前，需要方法来准确预测在那些患者中化疗的有效性。

发明内容

技术问题

因此，本发明人在他们发现，通过收集和分析从乳腺癌组织获得的临床信息以鉴定与预后预测相关的基因集、通过在所鉴定的基因中选择和组合适合于FFPE样品的基因和它们的集来开发可预测乳腺癌患者的预后的算法、和通过根据作为使用含有患者癌细胞和基因信息的组织的FFPE样品来开发用于预测乳腺癌患者预后的算法的大量工作的结果的上述算法来区分患者，从而可以预测乳腺癌患者的化疗化学有效性之后，完成了本发明。

因此，本发明的一个方面旨在提供一种用于预测乳腺癌患者的化疗有效性的方法，所述方法包括：

步骤a：在从所述乳腺癌患者获得的生物样品中测量选自由UBE2C(泛素缀合酶E2C)、TOP2A(拓扑异构酶2α)、RRM2(核糖核苷酸还原酶M2)、FOXM1(叉头框M1)和MKI67(增殖标志物Ki-67)组成的组中的至少一种增殖相关基因、以及BTN3A2(嗜乳脂蛋白亚家族3成员A2)免疫相关基因的mRNA表达水平；