[发明专利]预测进展期胃癌患者的术后预后或抗癌药物适合性的系统

权利要求书

1.一种预测II期和III期胃癌的预后或抗癌药物适合性的组合物，所述组合物包含：

用于测量预后或抗癌药物适合性相关标志物基因群的mRNA表达水平的试剂，所述标志物基因群包括WARS、GZMB、CDX1和SFRP4；和

用于测量参照基因群的mRNA表达水平的试剂，所述参照基因群包括ACTB、ATP5E、GPX1、UBB和HPRT1。

2.根据权利要求1所述的组合物，其特征在于，用于测量预后或抗癌药物适合性相关标志物基因群或参照基因群的mRNA表达水平的试剂包括序列与所述mRNA互补的寡核苷酸。

3.根据权利要求1所述的组合物，其特征在于，用于测量预后或抗癌药物适合性相关标志物基因组或参照基因群的mRNA表达水平的试剂包括SEQ ID NO:1至18中所示的引物组；或SEQ ID NO:19至27中所示的探针。

4.根据权利要求1所述的组合物，其特征在于，所述组合物用于在总体存活率或无病存活率方面预测II期和III期胃癌患者的预后或抗癌药物适合性的概率。

5.一种预测II期和III期胃癌的预后或抗癌药物适合性的试剂盒，所述试剂盒包括：

权利要求1所述的组合物。

6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒是逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)试剂盒或DNA芯片试剂盒。

7.一种提供预测II期和III期胃癌预后的信息的方法，所述方法包括：

测量自II期和II期胃癌的肿瘤获得的生物样品中的预后或抗癌药物适合性相关标志物基因群以及参照基因群的mRNA表达水平，并根据以下等式1计算预后或抗癌药物适合性相关标志物基因的ΔCq值，所述标志物基因群包括WARS、GZMB、CDX1和SFRP4，所述参照基因群包括ACTB、ATP5E、GPX1、UBB和HPRT1；以及

与预先确定的预后或抗癌药物适合性相关参考标志物基因的最终阈值相比较，

当生物样品中GZMB和WARS的ΔCq值高于预先确定的参考GZMB和WARS的最终阈值时，将组分类为预后良好组(预后群I)，以及

倘若在生物样品中GZMB和WARS的至少一个ΔCq值低于预先确定的参考GZMB或WARS的最终阈值时，当生物样品中SFRP4的ΔCq值低于预先确定的参考SFRP4的最终阈值时，将组分类为预后中等组(预后群II)，当SFRP4的ΔCq值高于预先确定的参考SFRP4的最终阈值时，将组分类为预后不良组(预后群III)，

其中，对于WARS、GZMB、CDX1和SFRP4，预先确定的预后或抗癌药物适合性相关参考标志物基因的最终阈值分别为-2.14、-5.18、-2.69和-3.63，以及

通过获得来自II期和III期胃癌的肿瘤组织样品的包括WARS、GZMB、CDX1和SFRP4的预后或抗癌药物适合性相关标志物基因的ΔCq值、使用该ΔCq值计算每种基因的自适应回归值、以及将每种基因的校正值与自适应回归值相加，来计算最终阈值，WARS、GZMB、CDX1和SFRP4的自适应回归值分别为-2.54、-5.58、-3.59和-4.53，并且其校正值分别为+0.4、+0.4、+0.9和+0.9，

[等式1]

ΔCq＝(参照基因群的Cq值)-(预后或抗癌药物适合性相关标志物基因的Cq值)

其中，参照基因群的Cq值是指包括ACTB、ATP5E、GPX1、UBB和HPRT1的参照基因的平均Cq值。

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述生物样品选自新鲜肿瘤组织、新鲜冷冻肿瘤组织、石蜡包埋的肿瘤组织、细针抽吸液、腹水、管清洗液或胸膜液。

9.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，通过RT-PCR、竞争性RT-PCR、实时RT-PCR、核糖核酸酶保护分析、Northern印迹或DNA芯片进行预后或抗癌药物适合性相关标志物基因群和参照基因群的mRNA表达水平的测量。