[发明专利]检测肝细胞癌

权利要求书

1.针对将肝细胞癌与正常对照区分开的两个或多个基因的引物制备用于表征生物样品的试剂盒的用途，其中所述两个或多个基因包括基因HOXA1和选自DAB2IP、TSPYL5、ACP1、BDH1、Chr12.133、CLEC11A、DBNL、EFNB2、LRRC4、SPINT2、CCNJ_3707、CCNJ_3124、PFKP、SCRN1以及ECE1中的一个或多个基因，所述用途包括：

如下测量人个体的生物样品中的所述两个或多个基因的CpG位点的甲基化水平：

用重亚硫酸盐处理所述生物样品中的基因组DNA；

使用针对所选择的两个或多个基因的引物组扩增所述重亚硫酸盐处理过的基因组DNA；并且

通过甲基化特异性PCR、定量甲基化特异性PCR、甲基化敏感性DNA限制酶分析、定量重亚硫酸盐焦磷酸测序或重亚硫酸盐基因组测序PCR测定所述CpG位点的甲基化水平，

其中，取决于所选择的两个或多个基因，使用以下引物扩增重亚硫酸盐处理的基因组DNA：

特异于HOXA1引物组，所述特异于HOXA1引物组特异性结合包括染色体7坐标27136145-27136425的遗传区域的至少一部分；

特异于DAB2IP引物组，所述特异于DAB2IP引物组特异性结合包括染色体9坐标124461305-124461420的遗传区域的至少一部分；

特异于TSPYL5引物组，所述特异于TSPYL5引物组特异性结合包括染色体8坐标98289858-98290220的遗传区域的至少一部分；

特异于ACP1引物组，所述特异于ACP1引物组特异性结合包括选自264204-264250和264087-264151的染色体2坐标的遗传区域的至少一部分；

特异于BDH1引物组，所述特异于BDH1引物组特异性结合包括选自197282831-197282922和197281722-197281827的染色体3坐标的遗传区域的至少一部分；

特异于Chr12.133引物组，所述特异于Chr12.133引物组特异性结合包括染色体12坐标133484978-133485739的遗传区域的至少一部分；

特异于CLEC11引物组，所述特异于CLEC11引物组特异性结合包括染色体19坐标51228217-51228732的遗传区域的至少一部分；

特异于DBNL引物组，所述特异于DBNL引物组特异性结合包括染色体7坐标44080227-44080310的遗传区域的至少一部分；

特异于EFNB2引物组，所述特异于EFNB2引物组特异性结合包括选自107188064-107188108、107188196-107188212、107187748-107187766、107187768-107187785、107188435-107188478、107188935-107189019、107188790-107188904、107187702-107187716和107188503-107188558的染色体13坐标的遗传区域的至少一部分；

特异于LRRC4引物组，所述特异于LRRC4引物组特异性结合包括选自127671917-127672169和127672388-127672445的染色体7坐标的遗传区域的至少一部分；

特异于SPINT2引物组，所述特异于SPINT2引物组特异性结合包括染色体19坐标38755130-38755164 的遗传区域的至少一部分；

特异于CCNJ_3707引物组，所述特异于CCNJ_3707引物组特异性结合包括染色体10坐标97803707-97803733的遗传区域的至少一部分；

特异于CCNJ_3124引物组，所述特异于CCNJ_3124引物组特异性结合包括染色体10坐标97803124-97803152的遗传区域的至少一部分；

特异于PFKP引物组，所述特异于PFKP引物组特异性结合包括选自3110620-3110694、3110554-3110609、3111174-3111244和3110913-3110978的染色体10坐标的遗传区域的至少一部分；

特异于SCRN1引物组，所述特异于SCRN1引物组特异性结合包括选自30029222-30029267、30029115-30029160和30029187-30029209的染色体7坐标的遗传区域的至少一部分；和

特异于ECE1引物组，所述特异于ECE1引物组特异性结合包括染色体1坐标21616801-21616877的遗传区域的至少一部分。