[发明专利]用于单分子检测的阵列及其应用

权利要求书

1.一种产生阵列的方法，所述方法包括：

分别确定第一靶探针和第二靶探针与多个捕获探针的杂交效率，其中所述第一靶探针和第二靶探针以及所述多个捕获探针是寡核苷酸探针，所述第一靶探针包含第一标记或序列，所述第二靶探针包含与所述第一标记或序列不同的第二标记或序列；

基于所述杂交效率预选择所述多个捕获探针在基板上将要被固定的密度；和

根据所述密度将所述多个捕获探针固定至所述基板，从而在所述基板上产生多个元件。

2.如权利要求1所述的方法，其中：

所述产生步骤还包括：在固定所述多个捕获探针之前或之后使所述第一靶探针和第二靶探针与所述多个捕获探针的至少一部分杂交，并产生分别包含(i)所述第一靶探针和第二靶探针且包含(ii)所述多个捕获探针的第一经固定杂交产物和第二经固定杂交产物；并且

预选择所述多个捕获探针的所述密度使得当将第一靶探针和第二标靶针在相同的杂交条件下施加到所述多个元件中的至少一个上时，在所述多个元件中的所述至少一个中，所述第一经固定杂交产物的第一密度与所述第二经固定杂交产物的第二密度相同或者相差20％以下。

3.如权利要求2所述的方法，其中：

所述第一靶探针和第二靶探针分别包含第一标记和第二标记，

所述第一经固定杂交产物和第二经固定杂交产物中的所述第一靶探针和第二靶探针的所述第一标记和第二标记是光学上能够解析的，并且

预选择所述多个捕获探针的所述密度使得所述多个捕获探针的所述密度被选择成其最大值，在该最大值下，(i)所述第一经固定杂交产物中的所述第一靶探针的第一标记中的至少两个是光学上能够解析的，且(ii)所述第二经固定杂交产物中的所述第二靶探针的第二标记中的至少两个是光学上能够解析的。

4.如权利要求2所述的方法，其中：

所述第一靶探针和第二靶探针分别包含所述第一标记和第二标记，

所述第一经固定杂交产物和第二经固定杂交产物中的所述第一靶探针和第二靶探针的所述第一标记和第二标记是光学上能够解析的，并且

预选择所述多个捕获探针的所述密度使得所述多个捕获探针的所述密度被选择成其最大值，在该最大值下，(i)所述第一经固定杂交产物中的所述第一靶探针的第一标记中的至少50％是光学上能够解析的；且(ii)所述第二经固定杂交产物中的所述第二靶探针的第二标记中的至少50％是光学上能够解析的。

5.如权利要求1～4中任一项所述的方法，其中，所述预选择步骤包括：

将所述多个捕获探针以不同的密度固定至所述基板，从而在所述基板上产生具有不同密度的捕获探针的多个对照元件，

在相同的杂交条件下(i)将所述第一靶探针施加至所述多个对照元件中的至少两个上和/或(ii)将所述第二靶探针施加至所述多个对照元件中的至少两个上，和

确定在所述多个对照元件中的所述至少两个的每一个中，所述第一靶探针和/或第二靶探针中的第一标记和/或第二标记是否是光学上能够解析的。

6.如权利要求1～5中任一项所述的方法，其中，所述第一靶探针和第二靶探针中的每一个包含共同的标签核苷酸序列，并且所述多个捕获探针包含与所述共同的标签核苷酸序列互补的共同的互补标签核苷酸序列。

7.如权利要求1～5中任一项所述的方法，其中，所述第一靶探针和第二靶探针包含彼此不同的第一标签核苷酸序列和第二标签核苷酸序列，并且所述多个捕获探针包含第一捕获探针和第二捕获探针，所述第一捕获探针和第二捕获探针分别具有与所述第一标签核苷酸序列和第二标签核苷酸序列互补的第一互补标签核苷酸序列和第二互补标签核苷酸序列。

8.如权利要求7所述的方法，其中，所述多个元件包含第一元件和第二元件，并且所述第一元件和第二元件各自包含所述第一捕获探针和第二捕获探针。

9.如权利要求7所述的方法，其中，所述多个元件包含第一元件和第二元件，并且所述第一元件和第二元件分别包含所述第一捕获探针和第二捕获探针。