[发明专利]Ω扩增

权利要求书

1.一种使用链置换等温扩增反应检测样品中的模板核酸的方法，其包括

(i)通过将该样品与以下各项组合来生成该反应：(a)一种或多种扩增引物，其被配置成在合适的扩增条件下由该模板核酸生成扩增子核酸，和(b)链置换扩增聚合酶；

(ii)在合适的扩增条件下维持该反应；以及

(iii)通过在步骤(ii)过程中或之后监测(c)在合适的扩增条件下与该模板核酸、其补体、该扩增子核酸或其补体杂交的特异性检测探针与(d)通用检测探针之间的相互作用来检测在步骤(ii)中是否发生扩增或是否已经发生扩增。

2.权利要求1的方法，其中该通用检测探针是通用FQ探针。

3.权利要求1或权利要求2的方法，其中该通用检测探针在合适的扩增条件下不退火至该模板核酸或其补体。

4.权利要求1-3中任一项的方法，其中该特异性检测探针和该通用检测探针之间的相互作用是通过扩增期间的杂交。

5.权利要求1-3中任一项的方法，其中该特异性检测探针和该通用检测探针之间的相互作用是通过该特异性检测探针的补体和该通用检测探针之间的杂交。

6.权利要求1-3中任一项的方法，其中该特异性检测探针和该通用检测探针之间的相互作用是通过扩增期间的杂交和聚合酶延伸。

7.权利要求1-3中任一项的方法，其中该特异性检测探针包含内部化学部分以阻止聚合酶延伸。

8.权利要求1-7中任一项的方法，其中该通用检测探针包含第一检测寡核苷酸链和第二检测寡核苷酸链。

9.权利要求8的方法，其中(a)第一检测寡核苷酸链包含淬灭剂部分且第二检测寡核苷酸链包含荧光团，或(b)第一检测寡核苷酸链包含荧光团且第二检测寡核苷酸链包含淬灭剂部分，其中该淬灭剂部分和该荧光团被配置为使得当第一检测寡核苷酸链和第二检测寡核苷酸链退火时，该淬灭剂部分淬灭该荧光团的荧光。

10.权利要求9的方法，其中包含该荧光团的检测寡核苷酸链的量与包含该淬灭剂部分的检测寡核苷酸链的量的比例小于1:1。

11.权利要求9或权利要求10的方法，其中检测步骤(ii)包括测量等温链置换扩增期间发射的荧光。

12.权利要求8-11中任一项的方法，其中第二检测寡核苷酸链包含与第一检测寡核苷酸链不互补的突出的不匹配区段。

13.权利要求8-12中任一项的方法，其中该特异性检测探针或其补体包括侵入序列，该侵入序列在扩增期间或之后与该突出的不匹配区段的一部分杂交，且与互补于第一检测寡核苷酸链的第二检测寡核苷酸链的一部分杂交。

14.权利要求12的方法，其进一步包括侵入序列踢除物探针，该侵入序列踢除物探针在它与第二检测寡核苷酸链杂交时在其3'端附近或在3’端包含错配。

15.权利要求14的方法，其进一步包括侵入序列踢除物替换探针以在该侵入序列踢除物探针沿着第二检测寡核苷酸链延伸时替换该侵入序列踢除物探针。