[发明专利]生物标志物数据库的生成和用途在审

专利信息
申请号: 201780033795.8 申请日: 2017-03-31
公开(公告)号: CN109416360A 公开(公告)日: 2019-03-01
发明(设计)人: 约翰·布卢姆;瑞恩·本茨;杰夫·琼斯;威廉·F·史密斯;村峰;布鲁斯·威尔考克斯 申请(专利权)人: 迪森德克斯公司
主分类号: G01N33/68 分类号: G01N33/68;G16H10/40;B01L3/00;G01N33/49
代理公司: 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 代理人: 蔡利芳
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 生物标志物 数据库 干燥血浆 患者分类 患者健康 斑点 检测 开发
【权利要求书】:

1.一种生物标志物数据库生成方法,其包括:

鉴定将要包括在数据库中的生物标志物集;

获得包含生物标志物组分的参考生物标志物分子,所述生物标志物组分在质谱迁移上与蛋白质生物标志物不同;

获得至少一个待测样品用于包含在所述数据库中;

向所述样品提供所述参考蛋白质生物标志物分子;

使所述样品经受质谱分析以生成质谱分析输出;

鉴定所述质谱分析输出中的所述参考生物标志物分子;以及

将可预测地相对于所述参考蛋白质生物标志物分子偏移的质谱斑点作为指示参考蛋白质生物标志物分子的斑点进行评分。

2.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子包含蛋白质、脂质、胆固醇、类固醇、药物和代谢物中的至少一种。

3.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子包含蛋白质。

4.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子包含至少10个不同的分子。

5.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子包含至少20个分子。

6.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子包含至少1000个不同的分子。

7.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子是同位素标记的。

8.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子包含使用H2、H3、重氮、重碳、重氧、S35、P33、P32和同位素硒中的至少一种标记的分子。

9.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子是化学修饰的。

10.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子是以下至少一种:氧化的、乙酰化的、甲基化的和磷酸化的。

11.如权利要求1所述的方法,其中所述参考生物标志物分子是所述生物标志物集内的人蛋白质的非人同源物。

12.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含干燥的血液样品。

13.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含干燥的血浆样品。

14.如权利要求1所述的方法,其中将所述至少一个样品采集在固体背衬上。

15.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含采集的呼吸样品。

16.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含10个样品。

17.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含1,000个样品。

18.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含在不同时间点从个体采集的样品。

19.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含在治疗之前和之后从个体采集的样品。

20.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含从多个个体采集的样品。

21.如权利要求1所述的方法,其中所述至少一个样品包含从在至少一种健康状态上不同的个体采集的样品。

22.如权利要求1所述的方法,其中使所述样品经受质谱分析包括LC梯度运行不超过15分钟。

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