[发明专利]通过分析甲基化DNA来检测肺肿瘤

权利要求书

1.一种试剂盒，其包含：

a)寡核苷酸的组，其与甲基化标记的组中每种甲基化标记特异性杂交，其中所述甲基化标记的组选自：

- 由ZNF781, BARX1,和EMX1组成的组；

- 由ZNF781, BARX1, EMX1, 和HOXA9组成的组; 和

- 由ZNF781, BARX1, 和 EMX1，以及以下一种或多种组成的组：SLC12A8, KLHDC7B,PARP15, OPLAH, BCL2L11, MAX.chr12.526, HOXB2, CYP26C1, SOBP, SUCLG2, SHOX2,NFIX, FLJ45983, B3GALT6, SP9, 和 SKI，

其中所述寡核苷酸的组中的每种寡核苷酸的至少一部分与所述甲基化标记的组中的甲基化标记特异性杂交，以及

b) 至少一种另外的寡核苷酸，其中所述另外的寡核苷酸的至少一部分与参考核酸特异性杂交。

2.如权利要求1所述的试剂盒，其中所述每种寡核苷酸的所述部分与包含所述甲基化标记的亚硫酸氢盐处理的DNA特异性杂交。

3.如权利要求1或权利要求2所述的试剂盒，其中所述试剂盒包括至少两种另外的寡核苷酸。

4.如权利要求1或权利要求2所述的试剂盒，其中所述试剂盒还包括亚硫酸氢盐。

5.如权利要求1至4中任一项所述的试剂盒，其中所述寡核苷酸的组包含选自以下一种或多种的寡核苷酸：捕获寡核苷酸、核酸引物对、核酸探针和侵入性寡核苷酸。

6.如权利要求1至5中任一项所述的试剂盒，其中所述试剂盒还包括固体支持体。

7.如权利要求6所述的试剂盒，其中所述固体支持体为磁珠。

8.如权利要求7所述的试剂盒，其中所述固体支持体包括一种或多种捕获试剂。

9.如权利要求8所述的试剂盒，其中所述捕获试剂为与所述甲基化标记的组互补的寡核苷酸。

10.一种包含反应混合物的组合物，所述混合物包含靶标核酸和与所述靶标核酸特异性杂交的寡核苷酸的复合物的组，其中靶标核酸的组选自：

- 由ZNF781, BARX1和EMX1组成的组；

- 由ZNF781, BARX1, EMX1, 和HOXA9组成的组；和

-由ZNF781, BARX1和EMX1, 以及以下一种或多种组成的组： SLC12A8, KLHDC7B,PARP15, OPLAH, BCL2L11, MAX.chr12.526, HOXB2, CYP26C1, SOBP, SUCLG2, SHOX2,NFIX, FLJ45983, B3GALT6, SP9, 和SKI，

其中所述寡核苷酸选自以下一种或多种：捕获寡核苷酸、核酸引物对、核酸探针、水解探针、瓣状测定探针和侵入性寡核苷酸。

11.如权利要求10所述的组合物，其中所述靶标核酸为亚硫酸氢盐转化的靶标核酸。

12.如权利要求10所述的组合物，其中所述靶标核酸包含核酸序列的组，其选自甲基化标记的组中的每种甲基化标记，其中甲基化标记的组选自：由SEQ ID NOS: 371, 21和106组成的组；

由SEQ ID NOS: 371, 21, 106, 和146组成的组；和

由SEQ ID NO: 371, 21和106，以及以下一种或多种组成的组： 287, 156, 234, 229,33, 181, 151, 68, 292, 319, 267, 219, 131, 384, 313, 和277。