[发明专利]用于促进靶向基因编辑的组合物及其使用方法在审

专利信息
申请号: 201780023792.6 申请日: 2017-02-16
公开(公告)号: CN109476706A 公开(公告)日: 2019-03-15
发明(设计)人: W·M·萨尔茨曼;P·格莱泽;R·巴哈尔;N·A·麦克内尔;D·H·兰利;E·基哈诺 申请(专利权)人: 耶鲁大学;卡内基梅隆大学
主分类号: C07K14/00 分类号: C07K14/00
代理公司: 上海德昭知识产权代理有限公司 31204 代理人: 郁旦蓉
地址: 美国康*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 靶向基因 三链体 优选 基因 纳米粒子组合物 干细胞因子 锌指核酸酶 寡核苷酸 利用基因 组合基因 增效剂 肽核酸 递送 亲和力 修饰 体内 细胞 应用
【权利要求书】:

1.一种三链体形成组合物,包含总体长度总计不超过50个核碱基的胡斯坦结合肽核酸(PNA)区段和沃森-克里克结合PNA区段,其中所述两个区段能够与细胞的基因组中包含多嘌呤链段的靶区域结合或杂交以诱导链侵入、置换以及所述两个PNA区段和所述细胞的基因组的所述多嘌呤链段间三链分子的形成,

其中所述胡斯坦结合区段通过胡斯坦结合而结合至靶双链体中至少五个核碱基长度,

其中所述沃森-克里克结合区段通过沃森-克里克结合而结合至靶双链体中至少五个核碱基长度,并且

其中所述PNA单体中的一个或多个是γPNA单体。

2.根据权利要求1所述的三链体形成组合物,其中所述胡斯坦结合区段包含一个或多个选自由假胞嘧啶、假异胞嘧啶及5-甲基胞嘧啶组成的组的化学修饰的胞嘧啶。

3.根据权利要求1或2所述的三链体形成组合物,其中所述沃森-克里克结合区段包含具有至多十五个核碱基的尾序列,所述尾序列通过沃森-克里克结合而结合至在所述三链体外的靶双链体。

4.根据权利要求1至3中任一项所述的三链体形成组合物,其中所述两个区段是通过连接子连接的。

5.根据权利要求4所述的三链体形成组合物,其中所述连接子是在1个与10个8-氨基-3,6-二氧杂辛酸单元之间。

6.根据权利要求1至5中任一项所述的三链体形成组合物,其中所述区段能够与β-珠蛋白基因中包含以下序列的区域形成三链分子:GAAAGAAAGAGA(SEQ ID NO:15),或TGCCCTGAAAGAAAGAGA(SEQ ID NO:16),或GGAGAAA(SEQ ID NO:17),或AGAATGGTGCAAAGAGG(SEQ ID NO:18),或AAAAGGG(SEQ ID NO:19),或ACATGATTAGCAAAAGGG(SEQ ID NO:20)。

7.根据权利要求1至5中任一项所述的三链体形成组合物,其中

(i)所述胡斯坦结合区段包含序列JTTTJTTTJTJT(SEQ ID NO:30)并且所述沃森-克里克结合区段包含序列TCTCTTTCTTTC(SEQ ID NO:22)或TCTCTTTCTTTCAGGGCA(SEQ ID NO:23);

(ii)所述胡斯坦结合区段包含序列TTTTJJJ(SEQ ID NO:31)并且所述沃森-克里克结合区段包含序列CCCTTTT(SEQ ID NO:25)或CCCTTTTGCTAATCATGT(SEQ ID NO:26);

(iii)所述胡斯坦结合区段包含序列TTTJTJJ(SEQ ID NO:32)并且所述沃森-克里克结合区段包含序列CCTCTTT(SEQ ID NO:28)或CCTCTTTGCACCATTCT(SEQ ID NO:29);

(iv)所述胡斯坦结合区段包含序列TJTTTTJTTJ(SEQ ID NO:36)并且所述沃森-克里克结合区段包含序列CTTCTTTTCT(SEQ ID NO:37);

(v)所述胡斯坦结合区段包含序列TTJTTJTTTJ(SEQ ID NO:38)并且所述沃森-克里克结合区段包含序列CTTTCTTCTT(SEQ ID NO:39);

(vi)所述胡斯坦结合区段包含序列JJJTJJTTJT(SEQ ID NO:40)并且所述沃森-克里克结合区段包含TCTTCCTCCC(SEQ ID NO:41);

(vii)所述胡斯坦结合区段包含序列JJTJTTJ(SEQ ID NO:56)并且所述沃森-克里克结合区段包含序列CTTCTCC(SEQ ID NO:46)或CTTCTCCAAAGGAGT(SEQ ID NO:47)或CTTCTCCACAGGAGTCAG(SEQ ID NO:48)或CTTCTCCACAGGAGTCAGGTGC(SEQ ID NO:205);

(viii)所述胡斯坦结合区段包含序列TTJJTJT(SEQ ID NO:49)并且所述沃森-克里克结合区段包含序列TCTCCTT(SEQ ID NO:50)或TCTCCTTAAACCTGT(SEQ ID NO:51)或TCTCCTTAAACCTGTCTT(SEQ ID NO:212);或

(ix)所述胡斯坦结合区段包含序列TJTJTTJT(SEQ ID NO:52)并且所述沃森-克里克结合区段包含序列TCTTCTCT(SEQ ID NO:53)或TCTTCTCTGTCTCCAC(SEQ ID NO:54)或TCTTCTCTGTCTCCACAT(SEQ ID NO:55);

其中“J”是假异胞嘧啶。

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