[发明专利]用于检测念珠菌属物种的方法和组合物

权利要求书

1.试剂在制备用于确定样本中念珠菌属物种的存在或不存在的方法中使用的试剂盒中的用途，其中所述念珠菌属物种包括白色念珠菌、都柏林念珠菌和热带念珠菌中的一种或多种，所述方法包括：

(1)使样本与第一念珠菌特异性扩增寡聚体和第二念珠菌特异性扩增寡聚体接触，所述样本疑似含有念珠菌属物种，

其中所述第一念珠菌特异性扩增寡聚体和所述第二念珠菌特异性扩增寡聚体分别包含第一和第二念珠菌特异性靶杂交序列，其中所述第一念珠菌特异性靶杂交序列由SEQ IDNO: 9的残基28-46的核苷酸序列组成，并且所述第二念珠菌特异性靶杂交序列由SEQ IDNO: 26的核苷酸序列组成，

其中所述第一念珠菌特异性扩增寡聚体是启动子引物或启动子提供者，所述启动子引物或启动子提供者进一步包含位于第一念珠菌特异性靶杂交序列的5’端上游的T7启动子序列，并且

其中所述第二念珠菌特异性扩增寡聚体是非启动子引物；

(2)进行体外核酸扩增反应，其中所述扩增反应是等温扩增反应，并且其中可能存在于所述样本中的任何念珠菌属物种靶核酸被用作模板以产生一种或多种扩增产物；以及

(3)检测所述一种或多种扩增产物的存在或不存在，其中所述检测包括（i）将一种或多种扩增产物与念珠菌特异性检测探针接触，所述念珠菌特异性检测探针特异性杂交至所述一种或多种扩增产物，其中所述念珠菌特异性检测探针是包含SEQ ID NO: 109的核苷酸序列并且进一步包含至少一个2’甲氧基修饰的分子火炬，并且（ii）检测杂交的念珠菌特异性检测探针存在或不存在，从而确定所述样本中念珠菌属物种的存在或不存在。

2.根据权利要求1所述的用途，其中所述T7启动子序列具有SEQ ID NO: 9的残基1-27的核苷酸序列。

3.根据权利要求1所述的用途，其中所述扩增反应是转录介导的扩增(TMA)反应。

4.根据权利要求1或3所述的用途，其中所述扩增反应是实时扩增反应。

5.一种用于确定样本中念珠菌属物种的存在或不存在的寡聚体组合，其中所述念珠菌属物种包括白色念珠菌、都柏林念珠菌和热带念珠菌中的一种或多种，所述寡聚体组合包含：

（a）第一念珠菌特异性扩增寡聚体和第二念珠菌特异性扩增寡聚体，

其中所述第一念珠菌特异性扩增寡聚体和所述第二念珠菌特异性扩增寡聚体分别包含第一和第二念珠菌特异性靶杂交序列，其中所述第一念珠菌特异性靶杂交序列由SEQ IDNO: 9的残基28-46的核苷酸序列组成，并且所述第二念珠菌特异性靶杂交序列由SEQ IDNO: 26的核苷酸序列组成，

其中所述第一念珠菌特异性扩增寡聚体是启动子引物或启动子提供者，所述启动子引物或启动子提供者进一步包含位于第一念珠菌特异性靶杂交序列的5’端上游的T7启动子序列，并且

其中所述第二念珠菌特异性扩增寡聚体是非启动子引物；并且

（b）念珠菌特异性检测探针，其中所述念珠菌特异性检测探针是包含SEQ ID NO: 109的核苷酸序列并且进一步包含至少一个2’甲氧基修饰的分子火炬。

6.根据权利要求5所述的寡聚体组合，其中所述寡聚体组合包含在反应混合物中。

7. 根据权利要求5所述的寡聚体组合，其中所述T7启动子序列具有SEQ ID NO: 9的残基1-27的核苷酸序列。