[发明专利]胶质瘤预后标志物circ1:246186743|246186942及应用

说明书

本发明公开了一种胶质瘤预后标志物circ1:246186743|246186942及应用。即检测胶质瘤组织来源的circRNA circ1:246186743|246186942的试剂用于制备胶质瘤患者的预后制剂。通过研究证实胶质瘤中circRNA circ1:246186743|246186942表达量较高的患者，拥有较差的术后生存率。通过检测胶质瘤患者胶质瘤组织中circ1:246186743|246186942的表达水平，从而对胶质瘤患者做出预后判断。

技术领域

本发明属于生物技术领域，涉及一种用于胶质瘤预后的circRNA标志物、以及检测该标志物的试剂用于制备胶质瘤预后制剂的应用、还有试剂盒。

背景技术

脑胶质瘤是颅内最常见的恶性肿瘤,国内脑胶质瘤的发生率占颅内肿瘤的35％～60％,5年生存率仅为20％～30％,是神经外科临床工作中面临的最严重的肿瘤之一。对脑胶质瘤的治疗措施,传统上仍然以手术为最重要的手段,但由于胶质瘤多为浸润型生长,单纯的手术治疗后,很容易复发,疗效并不能使人满意。因此，寻找胶质瘤预后标志物对患者进行预后分析，以提高胶质瘤患者的术后生存期，并相应地选择合理的后续治疗方案，是神经科学领域亟待解决的研究任务。

circRNA是在mRNA前体(pre-mRNA)剪切过程中,外显子的5′端与3′端以反向剪切(backsplicing)形式形成3′,5′磷脂键连接的circRNA。随着测序技术的发展,特别是转录组测序技术(RNA-seq)及其分析技术的发展,细胞内大量的circRNA被发现。现有的研究表明circRNA具有重要的生物学功能。circRNA具有细胞表达特异性,稳定性好且表达丰富等特点,使其作为肿瘤标志物具有潜在意义。

发明内容

本发明的第一个目的是：提供一种用于胶质瘤患者预后的胶质瘤组织来源的circRNA标志物circ1:246186743|246186942，其序列如SEQ NO:1所示。

本发明的第二个目的是，提供检测所述的circRNA标志物在胶质瘤组织中表达量的试剂在制备胶质瘤预后制剂中的应用。

本发明的第三个目的是，提供一种胶质瘤预后试剂盒，能够测定胶质瘤组织中的circ1:246186743|246186942的含量。

所述的胶质瘤预后试剂盒，含有检测circ1:246186743|246186942含量的PCR引物。优选引物的序列如SEQ NO:2和3所示。

所述的胶质瘤预后试剂盒，除circ1:246186743|246186942的引物外，还含有从胶质瘤组织中提取RNA并进行逆转录及荧光定量PCR的所有试剂。包括：

(1)从胶质瘤组织中抽提总RNA所用试剂，包括RNA稳定溶液、Trizol试剂、三氯甲烷、异丙醇、无酶水；

(2)以总RNA为模板将circ1:246186743|246186942逆转录为cDNA所用试剂，包括逆转录缓冲液、三磷酸碱基脱氧核苷酸、RNA酶抑制剂、MMLV逆转录酶以及circ1:246186743|246186942所用随机引物；

(3)将cDNA实时定量PCR所用试剂，包括circRNAcirc1:246186743|246186942实时荧光定量PCR特异性引物、GAPDH内参特异性PCR引物、实时荧光定量SYBR染料、无酶水。