[发明专利]胶质瘤诊断标志物circ1:43920404|43920928及应用有效
申请号: | 201711453662.4 | 申请日: | 2017-12-28 |
公开(公告)号: | CN107937527B | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
发明(设计)人: | 李沛瑶;武明花;赵春花;王蓉;刘庆;范礼;陈琼 | 申请(专利权)人: | 中南大学湘雅医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 长沙市融智专利事务所(普通合伙) 43114 | 代理人: | 袁靖 |
地址: | 410008 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 胶质 诊断 标志 circ1 43920404 43920928 应用 | ||
本发明属于生物技术领域,公开了一种胶质瘤诊断标志物circ1:43920404|43920928及应用。通过荧光定量PCR技术对胶质瘤患者血清外泌体中circ1:43920404|43920928的含量进行分析,发现胶质瘤患者血清外泌体中circ1:43920404|43920928表达水平相比于正常对照组明显降低(p0.0001),ROC曲线分析则显示其对胶质瘤具有较高诊断价值,AUC=0.877,p=0.003,敏感度和特异度分别为85.7%和100%。
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及一种用于胶质瘤诊断的血清外泌体circRNA标志物、以及检测该标志物的试剂用于制备胶质瘤诊断制剂的应用、还有试剂盒。
背景技术
胶质瘤是颅内发病率最高的恶性肿瘤,占颅内肿瘤的40.49%,虽然临床上采用手术、化疗结合的方法进行治疗,但由于其浸润性,对化疗药物低敏感性等原因,经常导致患者术后复发,严重威胁人类生命健康。而且一旦确诊,大部分都为胶质瘤中晚期,术后生存率不高。另外,在WHO3-4级即高级别脑胶质瘤患者中,预后较差,平均生存寿命不超过五年。因此,寻找胶质瘤诊断标志物对患者进行诊断分析,尽早确诊病情,并相应地选择合理的后续治疗方案,提高生存率,是神经科学领域亟待解决的研究任务。
circRNA是一类广泛且多样地存在于哺乳动物细胞中、具有调控基因表达作用的内源性非编码RNA分子,具有共价闭合的环形结构,广泛存在于各种细胞中,也是继microRNA(miRNA)后RNA家族的最新研究热点。近年来,随着深度测序技术的广泛应用和生物物理和信息学技术的快速发展,人们发现人类许多外显子的转录本可被非线性地反向剪接或通过基因重排而形成circRNA,且它们在所有剪接转录本中占了相当大的比例。近年来逐渐发现外泌体中也含有大量的circRNA,可能发挥重要作用。目前,由于circRNA具有丰富性、稳定性、高保守性和时空特异性等特点,在肿瘤诊断标志物方面正发挥越来越大的作用。
发明内容
本发明的第一个目的是:提供一种用于胶质瘤诊断的血清外泌体circRNA标志物。
主要内容包括:一种用于胶质瘤诊断的血清外泌体circRNA标志物circ1:43920404|43920928,其序列如SEQ NO:1所示。
本发明的第二个目的是,提供检测所述的circRNA标志物在血清外泌体中表达量的试剂在制备胶质瘤诊断制剂中的应用。
本发明的第三个目的是,提供一种胶质瘤诊断试剂盒,其能够测定血清外泌体中的circ1:43920404|43920928的含量。
所述的胶质瘤诊断试剂盒含有检测circ1:43920404|43920928含量的PCR引物。优选引物的序列如SEQ NO:2和3所示。
所述的胶质瘤诊断试剂盒,除circ1:43920404|43920928的引物外,还含有从血清中提取外泌体、由外泌体中提取RNA并进行逆转录及荧光定量PCR的所有试剂。包括:(1)提取血清外泌体所需试剂:Total Exosome Isolation Reagent(from serum),可由Invitrogen公司购得,货号4478360;(2)提取外泌体RNA所需试剂:Trizol试剂、三氯甲烷、异丙醇、75%乙醇、无酶水;(3)逆转录所需试剂:随机引物(Random Primer)、无酶水、5×逆转录缓冲液、三磷酸碱基脱氧核苷酸、RNA酶抑制剂、MMLV逆转录酶;(4)荧光定量PCR所需试剂:circ1:43920404|43920928上下游引物、GAPDH内参上下游引物、SYBR染料、无酶水。
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