[发明专利]普通小麦SNP位点标记及其在小麦相关性状检测中的应用有效
申请号: | 201711444314.0 | 申请日: | 2017-12-27 |
公开(公告)号: | CN107916299B | 公开(公告)日: | 2021-01-15 |
发明(设计)人: | 郑军;赵佳佳;杨三维;何真;赵志勇;李刘军;雷梦琳;刘霞;葛川;乔麟轶;常建忠;连晋;杨斌;郑兴卫;张建诚 | 申请(专利权)人: | 山西省农业科学院小麦研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅;白艳 |
地址: | 041000*** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 普通 小麦 snp 标记 及其 相关 性状 检测 中的 应用 | ||
1.检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦如下a-e任一性状中的应用:a、株高;b、分蘖数;c、穗长;d、千粒重;e、a-d中任2种或任3种或任4种组合;
所述Ta-7A-SNP354位点为序列5第354位。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述Ta-7A-SNP354位点的单元型为AA或GG或AG。
3.检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型的物质在选育千粒重、穗长、株高和/或分蘖数提高的小麦中的应用。
4.根据权利要求1-3中任一所述的应用,其特征在于:
所述检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型的物质如下1)或2):
1)为成套引物,所述成套引物包括序列表中序列3所示的单链DNA分子,以及序列表中序列4所示的单链DNA分子;
2)含有所述成套引物的PCR试剂或试剂盒。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于:
所述成套引物还包括序列表中序列1所示的引物,以及序列表中序列2所示的引物。
6.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于:
所述试剂盒还包括序列表中序列1所示的引物,以及序列表中序列2所示的引物扩增产物中含有的限制性内切酶酶切位点对应的限制性内切酶;
或,所述限制性内切酶为Taq Ⅰ。
7.一种鉴定或辅助鉴定小麦如下a-e任一性状的方法,为检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型为AA还是GG,Ta-7A-SNP354位点单元型为AA的待测小麦千粒重、穗长、株高和/或分蘖数大于Ta-7A-SNP354位点单元型为GG的待测小麦千粒重、穗长、株高和/或分蘖数;
或一种选育如下a-e任一性状提高的小麦的方法,为检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型为AA还是GG,选择单元型为AA的小麦进行选育,得到目的小麦;
a、株高;b、分蘖数;c、穗长;d、千粒重;e、a-d中任2种或任3种或任4种组合。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:
所述检测小麦基因组中Ta-7A-SNP354位点单元型为AA还是GG的方法为如下A)或B):
A)直接测序或者测序特异片段;
B)所示的方法包括如下步骤:
1)用序列表中序列1所示的引物,以及序列表中序列2所示的引物对待测小麦基因组DNA进行PCR扩增产物,得到所述特异片段;
2)用序列表中序列3所示的引物,以及序列表中序列4所示的引物对所述特异片段进行PCR扩增产物,得到PCR扩增产物;
3)用Taq Ⅰ酶切所述PCR扩增产物,得到酶切产物;
检测酶切产物:
若酶切产物大小为170-180bp,则所述待测小麦Ta-7A-SNP354位点的单元型为GG;
若酶切产物大小为150-160bp,则所述待测小麦Ta-7A-SNP354位点的单元型为AA。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于:
所述检测酶切产物为如下:
若酶切产物大小为178bp,则所述待测小麦Ta-7A-SNP354位点的单元型为GG;
若酶切产物大小为157bp,则所述待测小麦Ta-7A-SNP354位点的单元型为AA。
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