[发明专利]一种单细胞全基因组扩增试剂盒在审
申请号: | 201711405983.7 | 申请日: | 2017-12-22 |
公开(公告)号: | CN108165610A | 公开(公告)日: | 2018-06-15 |
发明(设计)人: | 李静;陈昌岳;李明明;赵慧茹;郑冠涛;路远;胡秋萍;张祥林 | 申请(专利权)人: | 上海美吉生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844;C12Q1/6806;C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 200120 上海市浦东新区中国(上海)*** | 国省代码: | 上海;31 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 扩增 全基因组 错误率 扩增试剂盒 试剂盒 样本 尿嘧啶核苷酸 固定样本 优化引物 酶处理 应用 切除 检测 拓展 | ||
1.一种单细胞全基因组扩增试剂盒,所述试剂盒包括:细胞裂解液、细胞裂解酶、磁珠、校正酶、反应终止液、预扩增缓冲液、终扩增缓冲液。
2.如权利要求1所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述细胞裂解液包括但不限于以下任一种:50mM KAc、20mM Tris-Ac、10mM MgAc、0.2%Trition X-100;1xPBS、1xThermo polbuffer、30mM Tris-HCl;10mM Tris-HCl、25mM EDTA、100mM NaCl;0.5%SDS、10mM Tris-HCl、50mM KCl;10mM Tris-HCl、100mM EDTA、0.5%SDS;30mM Tris-HCl、10mM EDTA、1%SDS;30mM Tris-HCl、2mM KCl、0.2%Triton X-100。
3.如权利要求1所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述校正酶为具有DNA糖基化酶活性的酶。
4.如权利要求1所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述校正酶包括但不限于以下一种或几种:UDG酶、核酸外切酶Ⅷ、单链选择性尿嘧啶-DNA糖基化酶、TU错配DNA糖基化酶、具有甲基结合域的尿嘧啶-DNA糖基化酶。
5.如权利要求1所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述反应终止液包括:尿嘧啶-糖基化酶抑制剂。
6.如权利要求1所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述预扩增缓冲液包括DNA聚合酶、BSA、dNTP、DNA聚合酶、无核酸水、第一随机引物。
7.如权利要求6所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述第一随机引物结构为:第一引物固定序列-第一引物随机序列-第一引物三联重复序列,其中所述第一引物固定序列如SEQ ID NO:1所示,具体为ATGACTGATCCTTGTGCTAGAGTGTAC。
8.如权利要求7所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述第一引物随机序列长度为4~20nt,优选地为4~10nt,更优选地为6~8nt。
9.如权利要求1所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述终扩增缓冲液包括DNA聚合酶、BSA、dNTP、DNA聚合酶、无核酸水、第二随机引物。
10.如权利要求9所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述第二随机引物结构为:第二引物固定序列-第二引物随机序列-第二引物三联重复序列,其中所述第二引物固定序列如SEQ ID NO:2所示,具为:ATGACTGATCCTTGTGCTAGAGTGTAC。
11.如权利要求10所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述第二引物随机序列长度为4~20nt,优选地为4~10nt,更优选地为6~8nt。
12.如权利要求7或10所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述第一引物中的三联重复序列为TTT,则所述第二引物中的三联重复序列GGG;所述第一引物中的三联重复序列为AAA,则所述第二引物中的三联重复序列
GGG;所述第一引物中的三联重复序列为TTT,则所述第二引物中的三联重复序列CCC;所述第一引物中的三联重复序列为AAA,则所述第二引物中的三联重复序列CCC。
13.如权利要求6或9所述的一种单细胞全基因组扩增试剂盒,其特征在于,所述DNA聚合酶包括但不限于以下一种或几种:vent DNA聚合酶、T7 DNA聚合酶、Bsu DNA聚合酶,大片段、T4 DNA聚合酶、DNA聚合酶I、(Klenow)大片段、DNA聚合酶I(E.coli)、TherminatorTMDNA聚合酶、Sulfolobus DNA聚合酶IV、phi29 DNA聚合酶、Bst2.0DNA聚合酶、Bst2.0 DNA聚合酶、Bst DNA聚合酶,全长、Bst DNA聚合酶、Deep VentRTMDNA聚合酶、VentR(exo–)DNA聚合酶、DNA聚合酶、热启动Taq DNA聚合酶、热启动Taq DNA聚合酶、Taq DNA聚合酶、热启动Taq DNA聚合酶、Taq DNA聚合酶大片段、Taq DNA聚合酶(提供不含镁离子的ThermoPol II缓冲液)、Taq DNA聚合酶(提供缓冲液)、热启动DNA聚合酶、DNA聚合酶、热启动Flex DNA聚合酶、超保真DNA聚合酶、热启动超保真DNA聚合酶、超保真DNA聚合酶、KAPA HiFi Uracil+ReadyMix(2x)、PfuTurbo Cx热启动DNA聚合酶。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海美吉生物医药科技有限公司,未经上海美吉生物医药科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201711405983.7/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。