[发明专利]土沉香、云南沉香、马来沉香的SNP分子标记及应用在审
申请号: | 201711398258.1 | 申请日: | 2017-12-22 |
公开(公告)号: | CN109486983A | 公开(公告)日: | 2019-03-19 |
发明(设计)人: | 林源吉;丁佳女;郑宜文 | 申请(专利权)人: | 杭州百迈生物股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
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地址: | 311228 浙江省杭州市大江东产*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 沉香 位碱基 快速鉴定 准确检测 碱基 物种 口岸 检验 应用 | ||
1.用于鉴定土沉香、云南沉香、马来沉香的SNP分子标记,其特征在于,所述SNP分子标记位于SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示序列的第81-84位碱基为TGCC则鉴定为土沉香,若第81-84位碱基为CGCT则鉴定为云南沉香,若第81-84位碱基为CGCC则鉴定为马来沉香。
2.权利要求1所述SNP分子标记在土沉香、云南沉香、马来沉香鉴定中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,从土沉香、云南沉香、马来沉香混合物种中分别鉴定出土沉香、云南沉香、马来沉香。
4.用于鉴定土沉香、云南沉香、马来沉香的寡核苷酸,其特征在于,所述核苷酸包括SEQID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3,或者SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所对应的cDNA或mRNA,所述核苷酸序列的第81-84位碱基为TGCC则为土沉香,若第81-84位碱基为CGCT则为云南沉香,若第81-84位碱基为CGCC则为马来沉香。
5.一种鉴定土沉香、云南沉香、马来沉香的试剂盒,其特征在于,包括用于特异性检测SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3序列第81-84位碱基为TGCC或者CGCT或者CGCC的一种或多种引物,或引物和探针的组合。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述引物和/或探针选自:用于测序检测的特异性扩增引物和测序引物,引物序列分别为:
上游引物F1:5'-CGTAACAAGGTTTTCGTAGGTGAAC-3'
下游引物R1:5'-GCTACGTTCTTCATCGAT-3'
测序引物:5'-CGTAACAAGGTTTTCGTAGGTGAAC-3';
或者,用于荧光定量PCR检测的扩增特异性扩增引物和探针,引物和探针序列分别为:
上游引物F2:5'-CCGTGAACGTTAATAACAATGTGC-3'
下游引物R2:5'-ATCAAGTTCCTTGGCGCAGTC-3'
探针2-1:5'-FAM-GTGTCGTTATGCCCATTCCCTCCT-BHQ1-3'
探针2-2:5'-HEX-GTGTCGTTACGCTCCATTCCCTCCT-BHQ1-3'
探针2-3:5'-ROX-GTGTCGTTACGCCCATTCCCTCCT-BHQ1-3';
或者,用于ARMS-PCR扩增的特异性扩增引物,引物序列为:
土沉香特异性引物:
上游引物T1:5'-GATGCGCGCTATGATTGAAC-3'
下游引物T2:5'-CGGTGTATGCCATGATGCA-3'
云南沉香特异性引物:
上游引物Y1:5'-GATGCGCGCTATGATTGTGT-3'
下游引物Y2:5'-CGGTGTATGCCATGATGCG-3'
马来沉香特异性引物
上游引物M1:5'-GATGCGCGCTATGATTGTAT-3'
下游引物M2:5'-CGGTGTATGCCATGATGCG-3'。
7.一种制备鉴定土沉香、云南沉香、马来沉香试剂盒的方法,包括制备检测反应试剂的步骤,其特征在于,所述反应试剂包含用于特异性检测SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ IDNO.3序列第81-84位碱基为TGCC或者CGCT或者CGCC的一种或多种引物,或引物和探针的组合。
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