[发明专利]一种影响猪主蹄生长的分子标记及其应用

说明书

本发明属于家畜分子标记制备技术领域，具体涉及一种影响猪主蹄生长的SNP标记及其应用。所述SNP标记为猪基因组第16号染色体第52293663位碱基由A到G的位点突变，对应于SEQ ID NO:1所示序列中的第218bp处。本发明提供的分子遗传标记可以用于种猪的主蹄生长情况的筛选，能够有效减少实际生产中种猪因主蹄过度生长而引发肢蹄疾病后被淘汰的机率，有效增加种猪的使用年限，提高经济效益。

技术领域

本发明属于分子标记辅助选择技术及动物遗传育种领域，特别涉及一种影响猪主蹄生长性状的分子标记及其应用。

背景技术

猪(Susscrofa)是偶蹄目哺乳动物，其第3、4趾特别发达，长短相等，称之为主蹄(图1)。主蹄主要用于承受猪体重，在猪行走、站立过程中起重要支撑作用。通常，母猪的主蹄长度在5厘米左右，而过度生长的主蹄长度能够达到13厘米。主蹄过长的带来的弊端是容易造成机械损伤，又因为蹄结构的特殊性，使得损伤很难恢复，进而又会影响猪的站立及饮食，增加怀孕母猪流产的机率。因此，肢蹄损伤种母猪通常会被淘汰，导致种母猪的使用年限缩短，造成较大的经济损失。

由于猪主蹄的最终长度在成年后才能观察到，而种猪的选种却在此之前，因此早期选择就显得尤为重要。然而，猪主蹄的生长涉及多个基因、位点及位点之间的相互作用。如果通过传统的选择手段进行将很难取得有效进展；而分子标记辅助选择(markerassisted selection，MAS)则可以通过影响选择时间、选择强度以及准确性而提高该性状的选择效果。目前应用较广泛的是利用单核苷酸多态性标记(single nucleotidepolymorphism，SNP)进行的分子标记辅助选择技术，即通过选择与目标性状紧密连锁的SNP标记来对育种材料进行选择，综合改良畜禽重要经济性状，是传统遗传育种与现代分子生物学育种相结合的育种方法。相较于传统的育种方法而言，分子标记辅助选择育种的方法能够实现早期选种和提高育种准确性的目标，从而加快育种进程。目前，尚未有人发现关于猪主蹄性状的分子标记。

大白猪(Yorkshire或Large White)是世界上著名的瘦肉型猪种之一，因其较高的繁殖力，较好的生长育肥性和适应性等特点，常被作为诸多合成系商品猪的母本，应用范围十分广泛。因此，对大白母猪的主蹄生长性状进行改良，将可以有效避免母猪因肢蹄异常而被淘汰，提高母猪的使用年限，能较大限度提高养殖效益。

发明内容

为克服上述现有技术中存在的缺点与不足，本发明的首要目的是提供一种影响猪主蹄生长性状的SNP标记，该分子标记可用于早期鉴定猪的主蹄性状，实现辅助育种。

本发明的另一目的在于提供一对引物用于检测该影响猪主蹄生长性状的SNP标记。

本发明的再一个目的在于提供一种早期鉴定猪主蹄生长情况的方法。

本发明的再一目的在于提供一种猪主蹄生长性状的遗传改良方法。

本发明的上述目的通过以下技术手段实现：

一方面，本发明提供了一种影响猪主蹄生长性状的分子标记，该分子标记的核苷酸序列SEQ ID NO:1所示，其中序列中的M是A或G，导致猪主蹄性状出现多态性。如果M是A，则猪主蹄生长为正常长度，如果M是G，则猪蹄生长过长。进一步地，作为一种优选的评价方式，猪主蹄生长长度过长为猪成体主蹄长度≥10cm；猪主蹄长度正常为猪成体主蹄长度＜10cm。

该分子标记的SNP位点对应于国际猪参考基因组11.1版本16号染色体上第52293663bp处的A>G突变；或者，所述分子标记的SNP位点为SEQ ID NO:1序列片段标注位置g.218A>G。

上述影响猪主蹄生长性状的分子标记在猪主蹄生长性状遗传育种中的应用，该应用也属于本发明的保护范围。