[发明专利]基于神经网络的人工标注白细胞的误差校准方法及装置有效

专利信息
申请号: 201711374057.8 申请日: 2017-12-19
公开(公告)号: CN108021903B 公开(公告)日: 2021-11-16
发明(设计)人: 曹汛;洪羽萌;沈瀚;闫锋;张丽敏;杨程;蔡悦;夏永泉;李智洋 申请(专利权)人: 南京大学
主分类号: G06K9/00 分类号: G06K9/00;G01N15/00
代理公司: 南京知识律师事务所 32207 代理人: 李媛媛
地址: 210046 江苏*** 国省代码: 江苏;32
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 基于 神经网络 人工 标注 白细胞 误差 校准 方法 装置
【权利要求书】:

1.基于神经网络的人工标注白细胞的误差校准方法,其特征在于,包括如下步骤:

S1,获取染色血细胞的原始RGB图像;

S2,将原始RGB图像映射到HSV空间中,分离出S通道;

S3,绘制S通道图像的直方图,根据阈值范围将S通道图像二值化,得到细胞的二值图像;

S4,将二值图像进行一系列形态学处理;

S5,用8邻域连通的方法提取经形态学处理后的细胞图像的边缘像素点,找到细胞上下左右的边缘像素点,然后分割细胞;具体步骤为:

(1)首先从上往下、从左往右对图像进行扫描,找到连通区域的第一个目标段,标记该段并且压入堆栈,作为“区域增长”的种子段;

(2)检查当前段的上下两行是否有重叠且未标记的目标段;如果不存在重叠的目标段,则把当前段弹出堆栈;如果存在重叠且未标记的目标段,则标记该段并且压入堆栈,作为新的“种子段”;本行目标段(Xs1,Xe1)和上下两行目标段(Xs2,Xe2)重叠的准则是:

Xs1-1≤Xe2并且Xe1+1≥Xs2

其中,Xs1表示本行目标段的起始坐标,Xe1表示本行目标段的结束坐标,Xs2表示上下两行目标段的起始坐标,Xe2表示上下两行目标段的结束坐标;

(3)后续操作不断从堆栈中取出种子段,重复步骤(2)直到堆栈为空,即标记完一个连通区域;

(4)接着搜索图像中下一个未标记的连通区域,重复上述步骤(1)-(3)直到图像中所有的连通区域标记完毕;

S6,挑选分割后细胞的图像,将每一类中特征明显的细胞图像作为训练细胞输入深度残差网络中,训练网络;

S7,将挑选后剩余的细胞作为测试细胞,用softmax分类器为测试细胞打分;如果最大分数大于或等于设定阈值,则归为某类;如果最大分数小于设定阈值,则归入子分类中;

S8,取步骤S6中训练细胞以及子分类中细胞边缘的任一像素点为极点,建立极坐标系,将所有像素点用极坐标变换一一映射到直角坐标系中;

S9,对于训练细胞,遍历细胞的边缘像素点,每个像素点作为极点,整个分割后的细胞图像极坐标变换后产生一张变换后的图像,每张图像有n个像素点,即变换n次;对于子分类中细胞,每张图像只变换一次;

S10,将训练细胞变换后的图像作为子分类网络的输入,重新训练深度残差网络,并保存网络参数;将子分类中细胞变换后的图像作为测试数据,用softmax分类器再次打分:如果细胞图像的最大得分大于或等于设定阈值,则该细胞图像归为某一子分类;如果最大得分小于设定阈值,则该细胞图像归为未分类细胞。

2.根据权利要求1所述的基于神经网络的人工标注白细胞的误差校准方法,其特征在于,所述步骤S3中,确定阈值范围的具体方法为:以白细胞为前景,其余细胞为背景,根据S通道直方图的波峰和波谷,找到分离前景与背景的临界点为0.229和0.184;大于0.184且小于0.229的点为背景,将其像素值设为0;小于或等于0.184的点为白细胞浆所在点,为前景,将其像素值设为255;大于或等于0.229的点为白细胞核所在点,为前景,将其像素值设为255。

3.根据权利要求1所述的基于神经网络的人工标注白细胞的误差校准方法,其特征在于,所述步骤S4中,将二值图像进行一系列形态学处理的具体方法为:先对二值图像进行填充运算,填补由于染色不均形成的漏洞;然后用bwareaopen函数去除小块,将颜色与细胞核相同的血小板去掉;再用1×1的模板进行闭运算处理,平滑细胞边缘区域;最后再次填充细胞,防止空洞。

4.根据权利要求1所述的基于神经网络的人工标注白细胞的误差校准方法,其特征在于,所述步骤S6中,训练细胞占总细胞数的2/3,训练细胞经过深度残差网络学习后,得到checkpoint文件,该文件存储了网络模型的各类参数。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于南京大学,未经南京大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201711374057.8/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top