[发明专利]一种基于CRISPR系统的基因组编辑方法及其应用有效
申请号: | 201711194336.6 | 申请日: | 2017-11-24 |
公开(公告)号: | CN107937432B | 公开(公告)日: | 2020-05-01 |
发明(设计)人: | 谢卡斌;陈凯园;丁丹 | 申请(专利权)人: | 华中农业大学 |
主分类号: | C12N15/82 | 分类号: | C12N15/82;C12N9/22 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 刘奇 |
地址: | 430000 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 crispr 系统 基因组 编辑 方法 及其 应用 | ||
1.一种基于CRISPR系统CRISPR/Cas9的基因组编辑方法,包括以下步骤:
1)将1个或多个重复的tRNA-gRNA串联单元置于编码基因的内含子中获得inPTG内含子;
2)将获得的inPTG内含子与含Cas9核酸酶基因的外显子融合成一个inPTG-Cas9基因;
3)利用单个启动子来驱动inPTG-Cas9融合基因的表达,获得表达载体;
4)将含inPTG-Cas9融合基因表达元件的载体导入受体细胞进行转录表达,获得Cas9核酸酶和多个gRNA;
5)所述gRNA与Cas9核酸酶共同作用编辑受体细胞基因组序列。
2.根据权利要求1所述的基因组编辑方法,其特征在于,步骤3)中所述启动子为Pol II型启动子。
3.根据权利要求2所述的基因组编辑方法,其特征在于,所述Pol II型启动子为UBI10启动子、PR5启动子或PR1启动子。
4.根据权利要求1所述的基因组编辑方法,其特征在于,所述步骤4)中载体为pRGEB33载体,所述pRGEB33载体的内含子的序列如SEQ ID NO.7所示。
5.根据权利要求1所述的基因组编辑方法,其特征在于,所述步骤4)中载体为pRGEB34载体,所述pRGEB34载体的内含子的序列如SEQ ID NO.8所示。
6.根据权利要求4或5所述的基因组编辑方法,其特征在于,所述内含子中插入BsaI酶切位点用于PTG片段的克隆。
7.一种基于CRISPR系统CRISPR/Cpf1的基因组编辑方法,包括以下步骤:
1)将1个或多个重复的tRNA-crRNA串联单元置于编码基因的内含子中获得intron(PTC)内含子;
2)将获得的intron(PTC)内含子与含Cpf1核酸酶基因编码区的外显子融合形成一个intron(PTC)-Cpf1融合基因;
3)在所述intron(PTC)-Cpf1融合基因序列前添加启动子获得启动子-intron(PTC)-Cpf1融合基因序列;
4)将所述启动子-intron(PTC)-Cpf1融合基因置于载体中,导入受体细胞进行转录表达,获得Cpf1核酸酶和多个crRNA;
5)所述crRNA与Cpf1核酸酶共同作用编辑受体细胞基因组序列。
8.根据权利要求7所述的基因组编辑方法,其特征在于,所述转录表达外显子的Cpf1核酸酶的过程中,利用剪接复合体剪切所述intron(PTC)-Cpf1融合基因中的包含tRNA-crRNA的内含子,然后利用tRNA加工系统切割其中的tRNA元件,释放多个crRNA。
9.根据权利要求7所述的基因组编辑方法,其特征在于,步骤1)中所述多个tRNA-crRNA串联单元替换为多个crRNA串联单元。
10.根据权利要求9所述的基因组编辑方法,其特征在于,所述替换后利用表达的Cpf1蛋白切割crRNA串联单元,释放多个crRNA。
11.权利要求1~5、7~10任意一项所述的基因组编辑方法,其特征在于,所述编辑包括为基因敲除、靶向基因激活/抑制、单碱基替换。
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