[发明专利]单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的引物系统、方法和应用在审
| 申请号： | 201711106825.1 | 申请日： | 2017-11-10 |
| 公开（公告）号： | CN107868824A | 公开（公告）日： | 2018-04-03 |
| 发明（设计）人： | 甘立佳;胡昌明;刘晶星;徐艳艳;海洋;王春晖;于世辉 | 申请（专利权）人： | 广州金域医学检验集团股份有限公司;广州金域医学检验中心有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司： | 广州华进联合专利商标代理有限公司44224 | 代理人： | 林青中,万志香 |
| 地址： | 510320 广东省广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 碱基 延伸 检测 ugt1a1 基因 多态性 引物 系统 方法 应用 | ||
1.一种单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的引物系统，其特征在于，包括扩增引物对和测序引物，其中，所述扩增引物对的上游引物和下游引物的序列分别如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示，所述测序引物的序列如SEQ ID NO:3所示。
2.如权利要求1所述的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的引物系统，其特征在于，所述扩增引物对和/或所述测序引物的使用浓度为5.0+0.2pmol/μl。
3.如权利要求1或2所述的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的引物系统在制备检测UGT1A1*6基因多态性试剂中的应用。
4.一种单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的试剂盒，其特征在于，含有如权利要求1或2所述的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的引物系统。
5.如权利要求4所述的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的试剂盒，其特征在于，还包括DNA提取试剂、PCR扩增试剂、单碱基延伸试剂和毛细管电泳试剂中的至少一种。
6.如权利要求4或5所述的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的试剂盒，其特征在于，还包括基因型为A/A的纯合突变的阳性对照试剂。
7.一种单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性的方法，其特征在于，使用如权利要求1或2所述的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性用的引物系统，所述方法包括如下步骤：
使用所述扩增引物对对基因组DNA进行PCR扩增；
使用所述测序引物对PCR扩增的产物进行单碱基延伸；
对单碱基延伸的产物进行片段分析。
8.如权利要求7所述的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性的方法，其特征在于，所述PCR扩增的条件是：先95℃、5min；再依次95℃、30s，55℃、30s，72℃、1min，共44个循环；再72℃延伸5min。
9.如权利要求7所述的单碱基延伸法检测UGT1A1*6基因多态性的方法，其特征在于，所述单碱基延伸的条件是：先94℃、10s；再依次53℃、5s，58℃、30s，共30个循环；最后4℃保温。
10.如权利要求7～9中任一项所述的用于检测UGT1A1基因启动子区TA重复多态性的方法，其特征在于，所述对单碱基延伸的产物进行片段分析是对单碱基延伸的产物进行毛细管电泳，检测产物的峰值。
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