[发明专利]一种基于卷积神经网络的组织病理学图像分类方法在审

专利信息
申请号: 201711105308.2 申请日: 2017-11-10
公开(公告)号: CN107886127A 公开(公告)日: 2018-04-06
发明(设计)人: 夏春秋 申请(专利权)人: 深圳市唯特视科技有限公司
主分类号: G06K9/62 分类号: G06K9/62;G06N3/04
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 518057 广东省深圳市高新技术产业园*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 卷积 神经网络 组织 病理学 图像 分类 方法
【权利要求书】:

1.一种基于卷积神经网络的组织病理学图像分类方法,其特征在于,主要包括创建数据集(一);微调协议(二);预训练的卷积神经网络(CNN)作为特征提取器(三);微调的CNN作为分类器(四)。

2.基于权利要求书1所述的基于卷积神经网络的组织病理学图像分类方法,其特征在于,与从零开始训练的CNN相比,特征提取器和转移网络都能够提高Kimia Path24数据集的分类精确度,使得检索和分类准确性显著提高。

3.基于权利要求书1所述的创建数据集(一),其特征在于,用于训练和测试CNN的数据是由24个全扫描图像(WSI)组成的Kimia Path24,手动从超过350次的扫描中选择,描绘具有不同纹理图案的不同身体部位;对于每个图像,可以通过检查头文件中的描述标记来确定分辨率;例如,如果分辨率是0.5μm,那么放大倍数是20倍,如果分辨率是0.25μm,那么放大倍数是40倍;创建数据集包括补丁选择和精度计算。

4.基于权利要求书3所述的Kimia Path24数据集,其特征在于,数据集提供27055个训练补丁和1325个(手动选择的)大小为1000×1000(0.5mm×0.5mm)的测试补丁;扫描中测试补丁的位置已经被去除;Kimia Path24数据集忽略了颜色,所有的补丁都保存为灰度图像,Kimia Path24数据集是公开可用的。

5.基于权利要求书3所述的补丁选择,其特征在于,要创建Kimia Path24数据集,每个扫描都被分成1000×1000个像素的补丁,补丁之间没有重叠;背景像素(即,非常明亮的像素)被设置为白色,并且忽略使用每个补丁的均匀性;选择标准的同质性是忽略每个小于99%均匀性的补丁;高阈值决定了没有显著纹理图案的补丁将被忽略;从一组补丁中,每次扫描有100个随机采样的补丁被选择用于微调过程;随后将每个补丁的值归一化为[0,1];这些补丁最终被缩小到了224×224,供入CNN架构;

按照上述步骤,首先根据均匀性阈值从每次扫描获得27055个补丁;然后,从每个类中随机抽取100个补丁,产生少于2400个补丁的训练集。

6.基于权利要求书3所述的精度计算,其特征在于,有ntot=1325个测试补丁属于24个集合其中s=0,1,2,…,23;查看一组实验检索到的图像R,可以将补丁扫描精度ηp定义为:

ηp=1ntotΣs∈S|R∩Γs|---(1)]]>

全扫描精度ηw可以定义为:

ηw=124Σs∈S|R∩Γs|---(2)]]>

总精度定义为η=ηp×ηw

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