[发明专利]测定土壤样品DNA提取率的方法在审
| 申请号: | 201711066676.0 | 申请日: | 2017-11-02 |
| 公开(公告)号: | CN107653300A | 公开(公告)日: | 2018-02-02 |
| 发明(设计)人: | 戴中民;徐建明 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司33212 | 代理人: | 金祺 |
| 地址: | 310058 浙江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 测定 土壤 样品 dna 提取 方法 | ||
1.Aliivibrio fischeri菌株DNA的用途,其特征是:利用Aliivibrio fischeri菌株DNA测定土壤样品的DNA提取率。
2.测定土壤样品DNA提取率的方法,其特征是包括如下步骤:
1)、培养Aliivibrio fischeri ATCC 7744T菌株,提取其DNA,作为测定土壤样品DNA提取率的内标;
2)、设计Aliivibrio fischeri中16S rRNA基因片段的特异性引物;
3)、先在土壤样品中加入内标的DNA,随后立即提取DNA;
4)、采用qPCR测定添加到土壤中内标的基因数量和提取之后土壤样品中内标的基因数量,计算DNA提取率。
3.根据权利要求2所述的测定土壤样品DNA提取率的方法,其特征是:
所述步骤2)中的特异性引物为:
正向引物Af-F:5'-GCGGAAACGACTTAACTGAACC-3'
反向引物Af-R:5'-GAAGGTCCCCCTCTTTGGTC-3'。
4.根据权利要求3所述的测定土壤样品DNA提取率的方法,其特征是:
内标DNA的添加量为土壤样品总DNA的0.1%-1%。
5.根据权利要求4所述的测定土壤样品DNA提取率的方法,其特征是所述步骤4)中:
测定内标基因数的方法为:荧光定量PCR(qPCR);
DNA提取率的计算公式为:DNA提取率=提取后内标的基因拷贝数/加入的基因拷贝数。
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