[发明专利]一种一体全自动化数字PCR检测系统及实施方法有效
申请号: | 201711044995.1 | 申请日: | 2017-10-31 |
公开(公告)号: | CN107904156B | 公开(公告)日: | 2021-06-29 |
发明(设计)人: | 黄章发;相双红 | 申请(专利权)人: | 领航基因科技(杭州)有限公司 |
主分类号: | C12M1/34 | 分类号: | C12M1/34;C12Q1/6851 |
代理公司: | 杭州求是专利事务所有限公司 33200 | 代理人: | 邱启旺 |
地址: | 310020 浙江省杭州市江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 一体 自动化 数字 pcr 检测 系统 实施 方法 | ||
本发明公开了一种一体全自动化数字PCR检测系统及实施方法,该系统包括左腔室和右腔室,左腔室和右腔室通过自动隔离门装置隔开;左腔室内设置有液滴生成装置;右腔室内设置有PCR扩增装置、生物芯片阅读装置;还包括负压装置,左腔室和右腔室均与负压装置的入口相通,负压装置使左腔室和右腔室形成负压,并使空气通过负压装置排出。本发明采用负压屏蔽技术,通过负压和高效过滤器结合,有效防止整体实验操作过程中对人员及环境的污染。本发明采用自动隔离门,通过隔离门装置,有效将整体设备功能区分为两个独立操作区,在核酸提取与核酸扩增过程中防止交叉污染。
技术领域
本发明属于医疗器械领域,尤其涉及一种一体全自动化数字PCR检测系统及实施方法。
背景技术
聚合酶链反应( polymerase chain reaction, PCR)是现代生命科学研究中最常规的实验方法之一, 其发展经历了 3 个主要阶段:
第一代PCR就是我们目前最常用的终点PCR技术,通过凝胶电泳获得定性的结果。
第二代实时定量PCR技术,它利用荧光试剂监控扩增,来实现相对定量。在开展基因表达分析时,需要标准曲线或参考基因来协助定量。
第三代数字PCR作为一种全新的核酸检测方法,通过反应体系均分到大量反应单元中独立地进行PCR,并依据泊松分布和阳性比例来计算核酸数量。目前数字PCR主要分为微滴式和芯片式两种,与传统PCR技术相比,微滴式数字PCR(简称ddPCR)具有高灵敏度、高精度、高耐受性和绝对定量的优点。
域值循环数( cycle threshold, Ct) 是实时荧光定量 PCR 的重要概念, 是指每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。对实时荧光定量 PCR 和dPCR 的原理进行比较后可以发现, dPCR 通过统计学原理直接给出靶序列的起始浓度,其结果不再依赖于 Ct 值 ,可以避免实时荧光定量 PCR 在低拷贝靶分子、 细微模板浓度差异中灵敏度和精确度相对较差的缺陷它不再依赖Cq值或内参基因,即可确定低至单拷贝的待检靶分子的绝对数目。微滴技术让数字PCR更低成本,且更实用。
微滴式数字PCR,将含有核酸分子的反应体系处理为纳升级的微滴,使每个微滴含或不含待检靶分子,且每个微滴都作为一个独立的 PCR 反应器,经 PCR 扩增后采用微滴阅读仪逐个对微滴进行检测,并以终点信号的有或无作为判断标准 (有荧光信号的微滴判读为“1” , 无荧光信号的微滴判读为“0” )。最后,根据泊松分布原理及阳性微滴的比例,利用分析软件计算待检靶分子的浓度或拷贝数,从而获得最终结果。
现有市场上的相关产品在操作过程中存在如下的问题:
1、 芯片分析过程中,从核酸提取到实验报告的输出,各流程环节涉及几十个操作步骤,十多种仪器设备。自动程度低,工作繁琐,对人员水平要求高。
2、 整体试验过程中自适应性不强,人力干扰因素大,重复性较差。
3、 试验过程分属使用不同的仪器设备,处于不同工作环境区域,物料转移过程中,对环境、样本、人员的污染风险较大。
4、 整体实验过程周期较长,人员的工作效率低,准确度差。
发明内容
为克服现有技术上的不足,本发明提供一种一体全自动化数字PCR检测系统及实施方法,以解决现有技术中灵活性、自适应性不强、人为干扰因素,重复性差的技术问题。
为了达到上述目的,本发明所采用的技术方案如下:一种一体全自动化数字PCR检测系统,所述系统包括左腔室和右腔室,左腔室和右腔室通过自动隔离门装置隔开;左腔室内设置有液滴生成装置;右腔室内设置有PCR扩增装置、生物芯片阅读装置;所述液滴生成装置用于将预混液进行提取,最后将预混液加到液态生物反应系统中,从而实现将核酸样本加载到生物芯片中;
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