[发明专利]基于Taqman‑MGB探针的人JAK2V617F突变检测试剂盒和方法在审

专利信息
申请号: 201711015883.3 申请日: 2017-10-26
公开(公告)号: CN107604069A 公开(公告)日: 2018-01-19
发明(设计)人: 陈至里;许嘉森;吴诗扬;严志会;周荣华 申请(专利权)人: 益善生物技术股份有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 广州华进联合专利商标代理有限公司44224 代理人: 万志香
地址: 510663 广东省广州市广州高新技术产业*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 基于 taqman mgb 探针 jak2v617f 突变 检测 试剂盒 方法
【说明书】:

技术领域

发明属于分子生物学领域,涉及医学和生物技术,具体的是涉及一种基于Taqman-MGB探针的人JAK2 V617F突变检测试剂盒和方法。

背景技术

骨髓增殖性肿瘤(myelo-proliferative neoplasm/myelodysplastic/myeloprolifer-ative disorder,MPN/MDS/MPD)是一种惰性肿瘤,主要包括慢性粒细胞白血病(CML),真性红细胞增多症(PV),原发性血小板增多症(ET),和原发性骨髓纤维化(PMF),慢性中性粒细胞白血病(CNL),慢性嗜酸细胞白血病/高嗜酸细胞综合症(CEL/HES)等。目前临床上所指的MPD通常为反映多能造血干细胞转化的PV、IMF和ET。MPD发病无特点且潜伏期长,常见于40-70岁,诊断时年轻病例约占20%。由于骨髓增殖性疾病患者缺乏典型的临床症状,除了CML以外,长期以来MPD中其他亚型的诊断主要依赖于形态学的检查,这往往不能确诊MPD的类型,进而患者无法得到有效的治疗。

JAK2是JAK(非受体型酪氨酸蛋白激酶之一,Janus激酶)家族中受到高度关注的一员,其广泛分布于体细胞胞质中,参与造血和免疫等系统的信号转导。多项研究证实,PV、ET、PMF等疾病中存在JAK2激酶V617F点突变。该突变位点在DNA序列的第1849位碱基,由胸腺嘧啶替代了原有的鸟嘌呤(G-T),导致编码蛋白第617位的苯丙氨酸被缬氨酸代替,引起该基因编码的酪氨酸激酶活性增高。JAK2 V617F是发生于干细胞水平的突变,2008年世界卫生组织将JAK2 V617F突变纳入了PV、PT和PMF的诊断标准。因此JAK2 V617F的检测已经成为PV、ET等骨髓增殖性肿瘤(MPN)的主要分子致病机制和诊断标志。

目前,对PV和ET的治疗方法主要是迅速放血(去除过多血小板或是降低血容量)和药物治疗(放射性核素磷、羟基脲或马利兰等)。PMF的治疗方法主要是对症和支持治疗,如巨脾切除或罗钙全(1,25(OH)2D3)治疗纤维化等。JAK2 V617F突变结合骨髓活检的组织学结果,可为ET和PMF诊断及MPD治疗提供依据。此外,JAK2突变对MPD患者的预后也有一定影响。在ET和PV患者中,JAK2 V617F表达高的,预后差,而在PMF患者中,JAK2 V617F表达低的,预后差。

JAK2 V617F突变检测多采用多采用PCR-限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)、突变特异性扩增系统(amplification refractory mutation system,ARMS)或者直接测序分析等方法,但前两者存在假阳性(或灵敏度较低),无法定量检测,后者检测较准确,但费时耗资,在MPD随访和分子缓解判断中的作用有限不适于临床诊断的推广应用。

发明内容

本发明的目的在于提供一种具有良好特异性以及灵敏度的基于Taqman-MGB探针的人JAK2 V617F突变检测试剂盒,该试剂盒具有检测分辨率高的优势。

为实现上述目的,本发明采用的技术方案如下:

基于Taqman-MGB探针的人JAK2 V617F突变检测试剂盒,包括有针对人JAK2 V617F的如SEQ ID NO.7-SEQ ID NO.8所示的引物和如SEQ ID NO.13-SEQ ID NO.14所示的探针;所述探针的5’端标记有荧光基团,3’端标记有淬灭基团。

SEQ ID NO.13-SEQ ID NO.14在检测体系中的浓度为200nM/ml;比例为SEQ ID NO.14:SEQ ID NO.13的用量比1:2。从而使检测纯合型样本时两通道检测的Ct差值足够大,检测杂合型样本时的Ct差值足够小。

在其中一个实施例中,所述试剂盒还包括有缓冲液、镁离子、dNTP、Taq酶。

在其中一个实施例中,所述探针5’端的荧光基团为FAM、VIC、或HEX中的一种,3’端的淬灭基团为NFQ。

本发明的另一个目的是提供一种基于Taqman-MGB探针的人JAK2 V617F突变检测方法。

实现上述目的技术方案如下。

基于Taqman-MGB探针的人JAK2 V617F突变检测方法,包括以下步骤:

(1)提取待测模板的DNA;

(2)配制反应液,在缓冲液中加入镁离子、dNTP、上述引物和探针、Taq酶;

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