[发明专利]一种基于大数据的黄花乌头DNA条形码及黄花乌头的鉴定方法有效
申请号: | 201710998366.6 | 申请日: | 2017-10-19 |
公开(公告)号: | CN107541521B | 公开(公告)日: | 2018-08-31 |
发明(设计)人: | 杨俊波;何俊;王家艳;王红;李德铢 | 申请(专利权)人: | 中国科学院昆明植物研究所 |
主分类号: | C12N15/29 | 分类号: | C12N15/29;C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 刘奇 |
地址: | 650000 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 数据 黄花 乌头 dna 条形码 鉴定 方法 | ||
1.一种基于大数据DNA条形码鉴定位点的黄花乌头鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待测样本DNA;
(2)利用DNA条形码引物进行PCR扩增,得到扩增产物,所述DNA条形码引物序列为SEQID NO.1和SEQ ID NO.2;
(3)对所述扩增产物进行测序,测序结果与SEQ ID NO.3比对,特异性位点为:第89bp为A,第443bp为A,第447bp为A,第491bp和第492bp为AT,第499bp为T,第577bp为C;
若扩增产物符合上述特异性位点序列信息,则该待测样本为黄花乌头。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述PCR的扩增体系为25µL,组份配比如下:10μmol/L正反向引物各1.0µL,25mmol/L 10×PCR缓冲液2.5µL,2.5mM dNTP 2.5µL,5unit/µL Taq DNA聚合酶 0.25µL,50~100ng/L模板DNA 1.0µL,ddH2O 16.75µL。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述PCR的扩增条件为:94℃预变性2 min,1循环;94℃变性30s,52℃退火1min,72℃延伸2min,35个循环;72℃延伸7min。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述测序为双向测序,所述测序的引物序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述测序的反应体系为5µL:其中ddH2O 3µL,10μmol/L正反向引物各0.25µL,测序反应混合物0.5µL,PCR纯化产物1µL。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述测序的反应条件为:96℃预变性10s,50℃退火5s,60℃延伸4min,33个循环。
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