[发明专利]一种检测待测样品中微生物的种类和相对含量的方法及其专用引物组合有效

专利信息
申请号: 201710947218.1 申请日: 2017-10-12
公开(公告)号: CN109652567B 公开(公告)日: 2022-05-10
发明(设计)人: 王丽丽;赵明玉;石振奋;赵孟;石太平;宋金良;刘如银 申请(专利权)人: 北京乐土医学检验实验室有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/06;C12N15/11
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 102206 北京市昌平区回龙观镇中*** 国省代码: 北京;11
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 检测 样品 微生物 种类 相对 含量 方法 及其 专用 引物 组合
【权利要求书】:

1.引物组合,由引物组和引物对X组成;

所述引物组由引物对V3、引物对V4和引物对V6组成;所述引物对V3由引物V3-FX和引物V3-RX组成;所述引物对V4由引物V4-FX和引物V4-RX组成;所述引物对V6由引物V6-FX和引物V6-RX组成;所述引物对X由引物X-FX和引物X-RX组成;

所述引物V3-FX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:甲区段和V3-F区段;所述引物V3-RX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:乙区段和V3-R区段;所述V3-F区段和所述V3-R区段特异靶向细菌16S rDNA中的V3区域;

所述引物V4-FX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:所述甲区段和V4-F区段;所述引物V4-RX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:所述乙区段和V4-R区段;所述V4-F区段和所述V4-R区段特异靶向细菌16S rDNA中的V4区域;

所述引物V6-FX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:所述甲区段和V6-F区段;所述引物V6-RX自5’端到3’端依次包括如下两个区段:所述乙区段和V6-R区段;所述V6-F区段和所述V6-R区段特异靶向细菌16S rDNA中的V6区域;

所述V3-F区段的核苷酸序列如序列表中序列3所示;

所述V3-R区段的核苷酸序列如序列表中序列4所示;

所述V4-F区段的核苷酸序列如序列表中序列5所示;

所述V4-R区段的核苷酸序列如序列表中序列6所示;

所述V6-F区段的核苷酸序列如序列表中序列7所示;

所述V6-R区段的核苷酸序列如序列表中序列8所示;

所述引物X-FX依次包括如下两个区段:Adapter5区段和read1区段;

所述引物X-RX依次包括如下两个区段:Adapter7区段和read2区段;

所述read1区段中3’末端的15-20个核苷酸与所述甲区段一致;

所述read2区段中3’末端的15-20个核苷酸与所述乙区段一致。

2.如权利要求1所述的引物组合,其特征在于:

所述Adapter5区段的核苷酸序列如序列表中序列28所示;

所述Adapter7区段的核苷酸序列如序列表中序列30所示。

3.如权利要求1所述的引物组合,其特征在于:

所述read1区段的核苷酸序列如序列表中序列29所示;

所述read2区段的核苷酸序列如序列表中序列31所示;

所述甲区段的核苷酸序列如序列表中序列1所示;

所述乙区段的核苷酸序列如序列表中序列2所示。

4.如权利要求1所述的引物组合,其特征在于:

所述引物V3-FX中,所述甲区段和所述V3-F区段之间还包括barcode FX区段;

所述引物V3-RX中,所述乙区段和所述V3-R区段之间还包括barcode RX区段;

所述引物V4-FX中,所述甲区段和所述V4-F区段之间还包括所述barcode FX区段;

所述引物V4-RX中,所述乙区段和所述V4-R区段之间还包括所述barcode RX区段;

所述引物V6-FX中,所述甲区段和所述V6-F区段之间还包括所述barcode FX区段;

所述引物V6-RX中,所述乙区段和所述V6-R区段之间还包括所述barcode RX区段;

所述barcode FX区段由8-10个核苷酸组成;所述barcode RX区段由8-10个核苷酸组成。

5.如权利要求4所述的引物组合,其特征在于:

所述barcode FX区段为barcode F1区段至barcode F16区段中的任一种;所述barcodeF1区段至所述barcode F16区段的核苷酸序列依次如序列表中序列9至序列24所示;

所述barcode RX区段为barcode R1区段至barcode R3区段中的任一种;所述barcodeR1区段至所述barcode R3区段的核苷酸序列依次如序列表中序列25至序列27所示。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于北京乐土医学检验实验室有限公司,未经北京乐土医学检验实验室有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201710947218.1/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top