[发明专利]一种与原发性肺癌辅助诊断相关的癌-睾丸基因遗传标志物及其应用

说明书

本发明属于基因工程及肿瘤医学领域，公开了一种与原发性肺癌辅助诊断相关的癌‑睾丸基因SNP标志物及其应用。该标志物为rs12166583、rs12477419、rs75764106、rs74640907、rs74377505、rs1007089、rs1433646、rs6001675、rs11125117、rs3747093和rs793598的组合。该标志物可用于制备原发性肺癌辅助诊断试剂盒，具有较好的临床应用前景。

发明领域

本发明属于基因工程及肿瘤医学领域，涉及原发性肺癌辅助诊断相关的癌-睾丸基因SNP标志物及其应用。

背景技术

恶性肿瘤是危害人类健康的重大疾病之一。自2010年以来，恶性肿瘤已经超过心脑血管疾病成为中国第一大死因，也成为我国最主要的公共卫生问题。肺癌是全球受累人数最多的恶性肿瘤之一。据国际癌症研究署(IARC)估计，2012年肺癌新发病例182.5万人，死亡159.0万人，分别占全部癌症新发病例及死亡人数的13.0％和 19.4％。由于持续増长的烟草消费、环境污染化及生活方式的改变，我国肺癌的发病形势亦日趋严峻，发病率和死亡率呈显著上升趋势。据中国肿瘤登记中心最新数据 (2009-2011年)估计，2015年我国男性和女性的肺癌发病人数分别为50.9万和22.4 万，肺癌死亡人数分别为43.2万和17.8万，均高于世界平均水平。由此可见，肺癌已成为一个亟待解决的重大公共卫生问题，严整威胁全世界及我国人民的生命和健康。

肺癌家庭聚集性研究显示，遗传因素在肺癌的发生中同样扮演重要角色。尽管80％以上的肺癌可以归咎为烟草暴露，但仅有不到20％的吸烟者发生肺癌，说明在同等环境暴露下，具有不同遗传背景的个体对肺癌的易感性不同。单核苷酸多态性(Singlenucleotide polymorphism，SNP)是指人群中出现频率大于1％的单个核苷酸的变异，包括转换、颠换、缺失和插入。近年来的研究表明人类基因组中可能每100-300个碱基对 (basepair，bp)就存在一个SNP，估计SNP总数在数百万个左右。正是这0.1％的遗传学差异决定着绝大多数性状的个体间差异，并且影响个体对疾病(包括肿瘤)的易感性、以及对药物的反应性等。因此，寻找影响肺癌遗传易感性的SNP，用于高危人群筛检，从而采取针对性的预防措施，是有效预防肺癌高发的策略之一。

在一些类比研究中，人们注意到精子发生和癌症形成具有很多的相似性：例如癌细胞无限增殖的能力与精原细胞持续优势分裂的能力相似；癌细胞染色体数目的异常与精母细胞减数分裂中染色体数目减半相似；癌细胞的转移与生精细胞的迁移相似等。精子发生的过程高效而有序，却与高度失控的细胞癌变过程存在诸多相似性。基于这些相似之处，一些学者提出：当癌基因和抑癌基因不存在明确驱动突变的情况下，一些本应沉默的生殖细胞(如精细胞、卵细胞等)相关基因重新激活，也可以驱动癌症的发生。

癌-睾丸基因(Cancer/testis genes,CT基因)是一类代表着精子发生和肿瘤形成相似性的基因，正常情况下它们只在睾丸组织中特异表达；而在肿瘤中却能够被异常激活，提示这类基因可能在细胞癌变和转移过程中发挥重要作用。因此，此类基因符合恶性肿瘤表观驱动基因的特征。1991年Van Der Bruggen等人采用自体分型 (autologous typing)技术，在一株黑色素细胞系中分离出首个CT抗原(MAGEA1)。 CT基因的研究成果有着很好的应用前景。首先，肿瘤组织中特异表达的CT抗原具有免疫原性，能够诱导机体产生免疫应答，从而控制肿瘤细胞的生长和增殖。肿瘤免疫治疗就是借助分子生物学技术和细胞工程技术，增强机体对抗癌症的免疫效应，控制癌症进展。