[发明专利]长链非编码RNA lnc-ALVE1-AS1表达Northern blot检测引物、试剂盒

说明书

本发明属于分子生物学领域，具体涉及一种长链非编码RNA lnc‑ALVE1‑AS1表达Northern blot检测引物及试剂盒。所述引物的序列如SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9所示。本发明进一步提供了lnc‑ALVE1‑AS1表达Northern blot检测试剂盒，为lnc‑ALVE1‑AS1表达规律分析提供了方法和基础，在生产实践可用于检测鸡群的禽白血病天然免疫状态。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，具体涉及一种长链非编码RNA lnc-ALVE1-AS1表达Northern blot检测引物及试剂盒。

背景技术

内源性反转录病毒(endogenous retroviruses)是基因组成分，被认为源于进化中感染生物体的反转录病毒。作为远古反转录病毒感染在宿主体内的残留，加之过去对它的功能不够了解，曾将其视为垃圾DNA(Junk DNA)。直至最近有研究表明，某些内源性反转录病毒不仅对早期胚胎发育和胚胎干细胞的多能性具有重要作用，还可能与细胞天然免疫有关。

最新研究发现，内源性反转录病毒转录物是长链非编码RNA(long non-codingRNA，lncRNA)的重要来源，具有激活干扰素应答反应的潜能。事实上，lncRNA在细胞生物学调控中的作用越来越受到重视，在抗病毒天然免疫中也具有重要调节作用。内源性反转录病毒衍生的lncRNA在对抗外源性反转录病毒增殖的作用机制将逐渐被阐明，有望成为抵抗外源性病毒的新型疫苗或免疫增强剂。

禽内源性白血病病毒ALVE是最早发现的内源性反转录病毒，可能与宿主免疫应答和遗传抗性有关。特别是，来源于鸡1号染色体上的内源性反转录病毒ALVE1(长度为7.5kb)与禽白血病病毒高度同源，可能与禽白血病病毒的感染和增殖具有一定关联。

发明内容

本发明通过高通量测序在鸡基因组中鉴定出一条禽内源性反转录病毒ALVE1衍生的反义长链非编码RNA，命名为lnc-ALVE1-AS1。研究表明，lnc-ALVE1-AS1可以激活细胞抗病毒干扰素应答反应并抑制与其高度同源的外源性J亚群禽白血病病毒增殖。因此，进一步了解lnc-ALVE1-AS1在不同抗性品系鸡中的表达规律显得尤为重要。本发明的目的是提供一种能检测lnc-ALVE1-AS1表达的检测引物及试剂盒。

本发明提供了用于检测长链非编码RNA lnc-ALVE1-AS1表达的特异性引物，所述特异性引物的序列如SEQ ID NO.8和SEQ ID NO.9所示。

本发明进一步公开了所述特异性引物在制备lnc-ALVE1-AS1Northern blot试剂盒中的应用。

本发明还提供了一种长链非编码RNA lnc-ALVE1-AS1表达Northern blot检测试剂盒，包括DIG标记探针、杂交液和检测液，用于制备DIG标记探针的特异性引物序列如SEQID NO.8和SEQ ID NO.9所示。

本发明提供的长链非编码RNA lnc-ALVE1-AS1 Northern blot检测引物、试剂盒，为检测lnc-ALVE1-AS1的表达规律提供了研究方法和基础。此外，在生产实践可用于检测鸡群的禽白血病天然免疫状态。

附图说明

图1是lnc-ALVE1-AS1Northern blot结果图。

图2是lnc-ALVE1-AS1在鸡1号染色体上的位置示意图。

图3是lnc-ALVE1-AS1激活抗病毒干扰素应答反应图。A：过表达lnc-ALVE1-AS1对病原模式识别受体基因表达的影响；B：过表达lnc-ALVE1-AS1对干扰素刺激基因表达的影响；C：过表达lnc-ALVE1-AS1对TLR3蛋白表达的影响。