[发明专利]一种与鸡产蛋性状相关的分子标记及其在鸡育种中的应用

说明书

本发明属于分子遗传学领域，具体涉及了一种鸡miR‑1b‑3p基因5′调控区与鸡性成熟及产蛋数性状相关的一个突变位点的分子标记方法及其在鸡育种中的应用，该突变位点为‑734(GA)位点，利用KASP技术对其在3个不同群体中进行基因分型并与产蛋性状关联分析，结果发现该位点与开产日龄及32周、48周产蛋数存在极显著(P0.01)相关，AA和AG基因型的开产日龄极显著早于GG基因型，AA与AG基因型32周产蛋数极显著高于GG基因型，但AA基因型48周产蛋数极显著高于AG和GG基因型；可见检测这个与产蛋性状相关联的分子标记，有助于选育早熟高产的蛋用品种/系，为地方鸡育种工作提供有利的帮助。

技术领域

本发明涉及分子遗传学领域，具体提供了一种与鸡产蛋性状相关的分子标记及其在鸡育种中的应用。

背景技术

MicroRNAs(miRNAs)是一类广泛存在于生物体内、长约18-25核苷酸单链非编码小RNA，miRNA通过与靶基因3'UTR特异性互补配对结合，在转录后调节mRNA表达水平，抑制转录后蛋白的翻译(Beilharz et al,2010)。MiR-1b-3p在非洲爪蟾、斑马鱼、小鼠和鸡等动物的骨骼肌、心肌细胞、软骨细胞中均有表达(Townley et al.,2010、Vey et al.,2010、Dylan et al.,2008、Kumi et al.,2010)。参与细胞增殖、分化，与人卵巢癌、乳腺癌、糖尿病等疾病相关(Peng et al.,2015、Lin et al.,2015、Liu et al.,2015、Anquan et al.,2017)。MiR-1-3p能抑制膀胱癌细胞的增殖、侵袭和迁移(Frederico,et al.,2017)。

分子标记辅助选择育种，是在分子水平上对目标性状进行选择，可以不受环境影响，通过遗传背景选择，减少连锁累赘，从而加速育种过程及精准度。基因表达是生命过程中的细胞把储存在DNA序列上的遗传信息经过转录和翻译，转变成蛋白质的过程。其中，转录受5′调控区序列的调控，其碱基突变通常会影响转录的起始，从而影响基因的表达。因此，研究鸡miR-1b-3p的5′调控区的SNPs，有助于找到有意义的分子标记，为鸡的标记辅助选择育种提供有利的理论依据。

发明内容

针对现有技术的上述情况，本发明提供了一种鸡miR-1b-3p基因5′调控区与鸡性成熟及产蛋数性状相关的一个突变位点的分子标记方法及其在鸡育种中的应用，该突变位点为-734(GA)位点，利用KASP技术对其在3个不同群体中进行基因分型并与产蛋性状关联分析，结果发现该位点与开产日龄及32周、48周产蛋数存在极显著(P0.01)相关，AA和AG基因型的开产日龄极显著早于GG基因型，AA与AG基因型32周产蛋数极显著高于GG基因型，但AA基因型48周产蛋数极显著高于AG和GG基因型；可见检测这个与产蛋性状相关联的分子标记，有助于选育早熟高产的蛋用品种/系，为地方鸡育种工作提供有利的帮助。

本发明所采用的技术方案是：

一种与鸡产蛋性状相关的分子标记，该分子标记为位于鸡miR-1b-3p基因5′调控区中与鸡产蛋性状相关联的突变位点，该突变位点为-734GA的突变；

上述与鸡产蛋性状相关的分子标记的标记方法，该方法所采用的两条引物分别为P-miR-1b-3p-F，P-miR-1b-3p-R；具体引物序列如下：

P-miR-1b-3p-F：

CCCTATCAGCCCATTTGT(其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示)

P-miR-1b-3p-R:

ATCCCATCCTCATCTCCAC(其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示)

上述引物是根据已发表红色原鸡基因组序列(GenBank Accession NC_006110)设计获得的，主要目的是筛选鸡miR-1b-3p 5′调控区的突变位点及确定其在群体中的分布；