[发明专利]一种包含基因突变的DNA鉴定亲权指数的计算方法有效
申请号: | 201710839552.5 | 申请日: | 2017-09-18 |
公开(公告)号: | CN107748837B | 公开(公告)日: | 2021-05-04 |
发明(设计)人: | 汪军;周密;王留柳;张韩秋;张科 | 申请(专利权)人: | 安徽工程大学 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00 |
代理公司: | 北京风雅颂专利代理有限公司 11403 | 代理人: | 杨红梅 |
地址: | 241000 安*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 包含 基因突变 dna 鉴定 指数 计算方法 | ||
1.一种包含基因突变的DNA鉴定亲权指数的计算方法,其特征在于,快速扫描确定符合遗传规律与基因突变不符合遗传规律,并根据扫描结果快速计算亲权指数,本方法通过概率理论方法重组与添加传统的符合遗传规律与基因突变不符合遗传规律各种状态计算公式,并将计算公式标识为字符串符号表;在鉴定过程中,对被鉴定者采用试剂盒检测的常染色体每一个STR基因座的基因型,采用自扫描字符递增法生成判定字符串,用字符串匹配的方法快速选择计算公式,计算单基因座的基因型的亲权指数,最后再求出多基因座的累计亲权指数;
该方法包括以下步骤:
步骤1.对二联体与三联体鉴定中双亲与孩子的单基因座基因型排列组合,重组单基因座的亲权指数(PI)计算公式,设计每个公式的计算函数;
步骤2.建立判定字符串与计算功能函数表映射表;将步骤1设计的每个PI计算函数名作为一个字符串,用字符串定位函数与求子串函数得到每个函数名字符串下划线之后的子串,作为判定字符串,将判定字符串与对应的函数地址一一对应,根据鉴定类型分5个类别建立判定字符串与计算功能函数表映射表IdentifyStrPICalTable;
步骤3.输入的二联体或者三联体鉴定类型,并输入二联体双亲-孩子基因数或者三联体两个双亲-孩子基因数的单基因座的数据;
步骤4.由于一对基因座的数据无先后关系,根据输入的鉴定类型,排列单基因座的数据的先后关系,对于二联体有四种排列,三联体有八种排列;
步骤5.取匹配的计算函数,根据基因数搜索基因频率数据库中的每个基因数的等位基因频率获得计算函数的参数,计算出计算亲权指数PI;
步骤6.二联体、三联体累积亲权指数的计算,所述步骤6亲子鉴定的STR基因座的亲权指数使用累积亲权指数定量评价,通过公式或计算。
2.根据权利要求1所述的一种包含基因突变的DNA鉴定亲权指数的计算方法,其特征在于,所述步骤3中二联体双亲-孩子基因数或者三联体两个双亲-孩子基因数的单基因座的数据,二联体母子鉴定为15/15,16/17;三联体亲母疑父鉴定为15/16,15/17,17/17。
3.根据权利要求1所述的一种包含基因突变的DNA鉴定亲权指数的计算方法,其特征在于,所述步骤4采用自扫描输入的基因型的排列,字符串字符递增法生成判定字符串算法。
4.根据权利要求1所述的一种包含基因突变的DNA鉴定亲权指数的计算方法,其特征在于,所述步骤4包括以下步骤:
步骤4.1取双亲-孩子等位基因数的一种排列为一数组,设定初始的递增字符A,从数组第一个数开始对每个等位基因数数组中每个数进行自扫描输入;
步骤4.2如果这个数之前的已经扫描过的数中出现该数,则这个数的判断字符与该数的字符相同,转步骤4.3;如果这个数之前的所有数中没有出现该数,则这个数的判断字符为递增字符,递增字符加1,转步骤4.3;
步骤4.3取等位基因数数组的下一个数,如果下一个数不存在,转步骤4.4;如果存在转步骤4.2,继续;
步骤4.4将每个基因数数组中的数转换成的判断字符顺序连接成一个字符串,则该字符串即为判定字符串;
步骤4.5在步骤2中建立的映射表IdentifyStrPICalTable中搜索,如果搜索到匹配的计算函数转步骤5计算亲权指数PI;如果这个等位基因数排列都不匹配,则转步骤4.1,测试下一种排列;二联体的四种排列或者三联体有八种排列都未搜素到匹配的,则该基因座无法计算,亲权指数设为1,不参与计算。
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