[发明专利]一种用于减少奶牛产犊间隔的分子标记及其检测方法

说明书

本发明属于分子生物学领域，具体涉及一种用于减少奶牛产犊间隔的分子标记及其检测方法。本发明公开了奶牛CXCR1基因816bp处A/C突变作为奶牛产犊间隔的分子标记的应用，并进一步提供了检测该分子标记的两种方法。将本发明公开的分子标记应用于奶牛辅助育种中，可以增加母牛产犊次数，从而减少因淘汰奶牛而购买其他奶牛的所产生的费用，如本发明在全国范围内推广应用，其间接产值可增加近80亿元以上，具有较好的应用前景。

技术领域

本发明属于分子生物学领域，具体涉及一种用于减少奶牛产犊间隔的分子标记及其检测方法。

背景技术

奶牛产犊间隔是指奶牛相邻2次产犊的时间间隔，是奶牛繁殖能力的综合反映。产犊间隔越短，则繁殖力越高，意味着农场主可以以较少的兽药、饲料等人力物力额投入，降低牧场的生产运营成本。因此，产犊间隔是一个重要的经济指标，它在增加牧场主的收入和保持牛群健康和稳定发展中有重要的作用。奶牛生产表明：奶牛产犊间隔每缩短1天，其饲养成本至少减少50元以上。随着对全球对奶牛产奶量等数量性状的高度选择，奶牛乳房炎、繁殖病症等疾病逐渐增加，因而其产犊间隔呈逐渐延长的趋势。目前国内大多数牛场产犊间隔平均约为400天左右。如果奶牛产犊间隔能缩短10天，按目前饲养成本50元/天计算，每胎可节约饲养成本500元。同时母牛终生产犊次数可增加，从而减少因淘汰奶牛而购买其他奶牛的所产生的费用。缩短产犊间隔可给牧场带来较大的经济效益。因此，急需一种能缩短产犊间隔的分子标记，并结合传统的奶牛育种、人工授精等技术，从而提高奶牛的繁殖性能，从而提高奶牛的终生生产价值和牛场的经济效益。

近年来，国内外围绕缩短奶牛产犊间隔从遗传角度进行了部分研究，发现了部分有价值的结果。周妍^[1]使用基因芯片对450头中英荷斯坦牛进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS),发现Rad54L(Rad54like,Rad样)和RRM1(Ribonucleotide reductase catalytic subunit M1，核糖核苷酸还原酶催化亚基M1)基因多态性对配种天数和空怀天数等性状有显著性影响。李鹏^[2]等报道Leptin基因外显子2的E2FB区上102bp处的突变对荷斯坦牛的产犊间隔有显著性影响。

CXCR1基因与机体免疫力、产科疾病等疾病有一定程度的关联。但CXCR1基因是否有可能与奶牛产犊间隔紧密相关，尚没有报道。

[1]周妍.荷斯坦奶牛繁殖性状相关的分子标记筛选与鉴定[D].华中农业大学,2013.

[2]李鹏,何举,赵国丽,等.荷斯坦牛Leptin基因外显子2多态性与繁殖力性状的相关性研究[J].中国奶牛,2011(6):4-7.

发明内容

为了解决现有技术存在的问题，本发明提供一种新的奶牛产犊间隔的分子标记及其检测方法，通过该分子标记辅助育种，能有效提高经济价值。

本发明所采用的技术方案是：

本发明公开了奶牛CXCR1基因CXCR1-816位点的A/C突变作为奶牛产犊间隔的分子标记的应用。在CXCR1-816位点，CC型奶牛产犊间隔显著低于AA型奶牛。

本发明还公开了用于上述奶牛产犊间隔分子标记的检测方法，可以采用PCR方法或/和飞行质谱方法进行检测。

所述的PCR方法具体是：以待测奶牛样本的DNA为模板，以SEQ ID No.1和2的序列为引物，进行PCR扩增，对扩增产物进行测序，测序结果与奶牛CXCR1基因参考序列(登录号：NM_001105038.1)进行比对，并判定CXCR1-816的基因型(图1)。