[发明专利]一种基于生物信息评估的方法在审

专利信息
申请号: 201710758218.7 申请日: 2017-08-29
公开(公告)号: CN107491665A 公开(公告)日: 2017-12-19
发明(设计)人: 姜涵予 申请(专利权)人: 北斗云谷(北京)科技有限公司
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18;G06F19/20
代理公司: 北京晟睿智杰知识产权代理事务所(特殊普通合伙)11603 代理人: 于淼
地址: 100000 北京市丰台区南四环西路18*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 生物 信息 评估 方法
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物医学领域,更具体地,涉及一种基于生物信息评估的方法。

背景技术

生物信息学(Bioinformatics)是在生命科学的研究中,以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。它是当今生命科学和自然科学的重大前沿领域之一,同时也将是21世纪自然科学的核心领域之一。其研究重点主要体现在基因组学(Genomics)和蛋白质组学(Proteomics)两方面,具体说就是从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中表达的结构功能的生物信息。

基因是DNA的片段,基因检测是指确定核酸序列和变异,生物解析是指根据基因检测结果,分析出基因的功能,也就是对基因对应的蛋白质进行结构分析和调控机制分析,并形成功能说明。人类基因组约为2.91Gbp,约39000个基因,基因平均大小为27kbp,目前已经发现和定位了26000多个功能基因。

各个医院和研究机构,经过多年的发展和积累,获取了大量的临床医学知识,包括疾病、易感、药品成分、用药药效和副作用等。

现有技术中,虽然积累了大量的临床医学知识和生物信息知识,但两者之间的关系却并不明确,生物信息跟临床医学知识的关联度不足20%,更难以基于生物信息对用户进行评估。

因此,现有技术中生物信息与临床医学知识关联度不足,是本领域亟待解决的问题。

发明内容

有鉴于此,本发明提供了一种基于生物信息评估的方法,解决了现有技术中生物信息与临床医学知识关联度不足的技术问题。

为了解决上述技术问题,本发明提出一种基于生物信息评估的方法,包括:

建立生物信息知识库,所述生物信息知识库,包括:疾病信息组和药物信息组,其中:

所述疾病信息组,包括:生物信息、所述生物信息对应的罹患疾病、所述罹患疾病的疾病分期、所述罹患疾病的疾病分型、所述生物信息对应的易感疾病和所述生物信息产生所述易感疾病的易感概率,其中:

所述生物信息,包括:基因组信息和蛋白组信息;其中:所述基因组信息,包括:单核苷酸多态性、拷贝数变异和基因甲基化;所述蛋白组信息,包括:代谢组学和疾病蛋白谱;

所述药物信息组,包括:所述生物信息、所述生物信息对应的有效药品成分、所述有效药品成分对应的对症疾病、所述有效药品成分的用药效果和所述有效药品成分的副作用;

建立医学知识库,所述医学知识库,包括:临床信息;其中:

临床信息,包括:生物信息、疾病信息、药物信息、运动方式、膳食习惯和情绪状态;其中:

疾病信息,包括:至少一种疾病;

药物信息,包括:至少一种药品成分;

选取临床信息中至少一种疾病或至少一种药品成分作为共有信息,提取包含共有信息的临床信息,组成临床信息组;

提取临床信息组作为生物信息知识库中生物信息的临床疾病组,其中:

临床疾病组中共有信息的名称,与生物信息知识库中生物信息对应的罹患疾病或易感疾病的名称相同;

获取用户的用户信息,包括:用户的生物信息;

将用户的生物信息作为目标生物信息;

从疾病信息组获取目标生物信息对应的罹患疾病作为目标罹患疾病,获取目标罹患疾病的疾病分期、目标罹患疾病的疾病分型、目标生物信息对应的易感疾病和易感概率,作为疾病建议信息;

从药物信息组中获取目标生物信息对应的有效药品成分作为目标药品成分,获取目标药品成分对应的对症疾病、目标药品成分的用药效果和目标药品成分的副作用,作为药物建议信息;

获取目标生物信息的临床疾病组作为目标临床疾病组,统计目标临床疾病组中药品成分、运动方式、膳食习惯和情绪状态的出现频率;

从目标临床疾病组中提取出现频率大于第一阈值的药品成分作为临床药品信息;

从目标临床疾病组中提取,出现频率大于第二阈值的运动方式、膳食习惯和情绪状态作为临床生活信息;

对用户进行评估得到评估结果,包括:疾病建议信息、药物建议信息、临床药品信息和临床生活信息。

可选的,在建立医学知识库之后,在获取用户的生物信息作为目标生物信息之前,还包括:

选取生物信息知识库中任一生物信息作为共有生物信息,提取共有生物信息对应的罹患疾病作为潜在疾病;

提取包含共有生物信息的临床信息,组成共有生物信息组;

计算临床病变概率,临床病变概率等于:共有生物信息组中具有潜在疾病的临床信息的个数除以共有生物信息组中临床信息的个数;

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