[发明专利]一种基于深度学习的病变区域自动分割方法在审
申请号: | 201710740014.0 | 申请日: | 2017-08-23 |
公开(公告)号: | CN107730507A | 公开(公告)日: | 2018-02-23 |
发明(设计)人: | 冯翱;马宗庆 | 申请(专利权)人: | 成都信息工程大学 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06N3/04;G06N3/08;G06T5/00 |
代理公司: | 北京华仲龙腾专利代理事务所(普通合伙)11548 | 代理人: | 李静 |
地址: | 610000 四川省成都*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 学习 病变 区域 自动 分割 方法 | ||
1.一种基于深度学习的病变区域自动分割方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1)采集多个病例数据,然后对病变部位特定模态的医学图像进行标准化预处理;
S2)由医学影像师对病变区域逐层进行边缘标注,将其作为真实数据;
S3)进行训练样本的提取,其包括:从病变区域内部和病变区域之外一定距离内的体素中,随机各抽取若干体素,并以该体素为中心取固定大小的图片块用于作为下一步的训练样本;图片中心在病变区域内部的作为正样本,图片中心在病变区域外的作为负样本,正负样本的图片块中均同时包含两类体素,即,病变区域内的体素和病变区域外的体素;
S4)建立深度学习神经网络,对上述病例的正负样本进行训练;进行后处理和分割精度测评,在网络参数收敛并取得满意分割精度后,得到分割模型;
S5)对于待诊断的病例,采集同部位同样模态的医学图像,然后使用相同的预处理参数进行标准化预处理;
S6)使用分割模型自动检测病变区域,然后输出分割结果。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,在步骤S4中,深度学习网络包括卷积神经网络(CNN)、循环神经网络(RNN)和二者的混合网络。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,所述卷积神经网络(CNN)由卷积层、下采样层、局部规范化、Dropout、全连接层和Softmax组成;所述循环神经网络(RNN)中的每层由多个LSTM单元组成,每层在训练阶段有Dropout,最后连接Softmax;混合网络的结构包含CNN中的卷积层、RNN中的RNN层和Softmax。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,对于待标注的区域每个体素,以其为中心取同样大小的图片块,然后通过训练完成的神经网络得到该体素属于病变区域的概率;对于所有体素同样进行处理后,得到该区域病变概率的热度图;对接近区域边缘的体素,如果图片块超出边缘,使用镜像进行补边。
5.如权利要求4所述的方法,其特征在于,在利用前述方法得到的热度图出现分割边缘不清晰、噪音严重的情况时,使用全局优化算法对其进行后处理,以得到平滑且清晰的分割边缘。
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