[发明专利]用于诊断不明原因复发性流产的增强子RNA组合、引物组及应用和试剂盒有效

专利信息
申请号: 201710735738.6 申请日: 2017-08-24
公开(公告)号: CN107447008B 公开(公告)日: 2020-09-25
发明(设计)人: 陆春城;黄振遥;范赟;韩秀梅;黄晓敏;韩莉;夏彦恺;王心如 申请(专利权)人: 南京医科大学
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12N15/11
代理公司: 北京思创大成知识产权代理有限公司 11614 代理人: 王尧
地址: 210029 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 用于 诊断 不明 原因 复发 流产 增强 rna 组合 引物 应用 试剂盒
【说明书】:

发明属于基因工程领域,涉及用于诊断不明原因复发性流产的增强子RNA组合、引物组及应用和试剂盒。所述增强子RNA组合包括:与SEQ ID NO:1所示核苷酸序列具有90%以上同源性的第一增强子RNA、与SEQ ID NO:2所示核苷酸序列具有90%以上同源性的第二增强子RNA和与SEQ ID NO:3所示核苷酸序列具有90%以上同源性的第三增强子RNA。本发明利用筛选出的增强子RNA组作为新的标志物,制备用于不明原因复发性流产诊断或监测的试剂盒,具有灵敏度高、检出谱系广、成本低等优点。

技术领域

本发明属于基因工程领域,更具体地,涉及用于诊断不明原因复发性流产的增强子RNA组合、引物组,以及增强子RNA组合与引物组的应用和试剂盒。

背景技术

复发性流产(recurrent spontaneous abortion,RSA)是指临床上连续2次或2次以上的孕20W前或胎儿体重不足500g的妊娠丢失,其发生率约占妊娠结局的1%~3%。RSA的病因极其复杂,目前已明确的病因有染色体异常、生殖解剖结构异常、内分泌失调、生殖系统感染、自身免疫和环境因素等,但临床上仍有50%~60%的RSA找不到明确的病因,称为不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)。胚胎发育异常是发生URSA的主要原因。胚胎发育是有机体从其生命起始到成熟的复杂进程,受一系列环境因素、遗传因素和表观遗传修饰的调控。

近年来,长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)重要生物学功能的发现使其成为生命科学研究的一大焦点,它们可在表观遗传、转录以及转录后等多个层面上调控基因的表达。在整个基因组转录产物中,lncRNA所占的比例远远超过编码RNA所占的比例。不同于编码RNA,lncRNA的保守性要差得多,然而在其分子内部,却含有较为保守的局部区段,且其表达具有时空特异性,这些现象都提示了lncRNA具有重要的生物学功能。

当lncRNA与转录因子结合之后,lncRNA能与目的基因形成染色质环从而调控靶基因的时空表达。2010年Greenberg在小鼠神经细胞中发现,分布在整个基因组中、由神经细胞去极化作用所激活的增强子均被转录,且增强子转录产生的lncRNA与增强子邻近的基因所转录的mRNA相关联。Rosenfeld等研究发现,在乳腺癌细胞中,雌激素与其受体结合会诱导lncRNA的转录,进而提高特定基因的表达,通过RNAi技术去除这些lncRNA,会减弱增强子上调基因表达的能力,同时减少增强子与启动子之间的成环现象。在胚胎发育方面,lncRNA的作用也正逐渐被证实。大量研究表明,lncRNA是胚胎发育和疾病发生过程中关键性的转录元件,可能是决定胚胎发育中基因时空表达的最早期分子之一,参与调控生长发育相关的基因。Samir等报道胚胎心脏发育受到lncRNA及其靶基因调控,lncRNA在胚胎干细胞向心肌细胞分化过程中发挥了一定作用。

lncRNA大多转录自“基因沙漠区”,但有些可以转录自基因组上的增强子(enhancer)元件,这类lncRNA被称为增强子RNA(enhancer RNA,eRNA)。增强子是DNA上可与转录因子结合的区域,可以位于基因上游,也可位于基因下游,甚至远离受调控的基因,且常伴有组蛋白的不同修饰。当与转录因子结合之后,增强子能与目的基因形成染色质环从而调控靶基因的时空表达。

目前还没有将增强子RNA应用于不明原因复发性流产辅助诊断的报道,若能筛选出不明原因复发性流产相关的增强子RNA作为生物标志物,并研制相应的诊断试剂盒,对不明原因复发性流产的诊断现状必将是一次有力的推动,也为其药物筛选、药效评价及靶向治疗开辟了一条新的途径。

发明内容

本发明的目的是提供用于诊断不明原因复发性流产的增强子RNA组合、引物组及应用和试剂盒。

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