[发明专利]一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法和系统有效
申请号: | 201710713359.7 | 申请日: | 2017-08-18 |
公开(公告)号: | CN107400713B | 公开(公告)日: | 2020-06-30 |
发明(设计)人: | 江丽;李彩霞;赵雯婷;刘京;黄美莎 | 申请(专利权)人: | 公安部物证鉴定中心 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888 |
代理公司: | 北京同立钧成知识产权代理有限公司 11205 | 代理人: | 彭雪瑞;黄健 |
地址: | 100038 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 27 群体 识别 中国 青藏高原 藏族 个体 方法 系统 | ||
本发明提供一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法和系统,所述方法包括提取个体的DNA;获得所述DNA的87个藏族特异高原适应SNP位点的基因型;将所述各特异性位点的基因型利用STRUCTURE软件获得所述个体的群体遗传成分分析结果,根据该结果识别该个体是否为中国青藏高原藏族群体个体。本发明提供的方案能将个体在27个群体中识别为中国青藏高原藏族群体个体或非中国青藏高原藏族群体个体。本发明的方案能增加针对东亚亚人群的分辨率,可为相关案件提供侦破线索。
技术领域
本发明涉及一种识别个体群体来源的方法和系统,尤其涉及一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法和系统。
背景技术
伴随经济全球化,不同国家、区域间的人员流动加大,涉外、反恐、跨区域流动作案等复杂案件不断增多,案件侦查的难度日益加大。例如,北京、上海、广东等大城市经常出现涉外案件。目前国际人种主要分为非洲、美洲、欧洲、南亚、东亚人种及由这些人种形成的混合人种。
通常,利用从案件现场生物检材中提取到的DNA中蕴含的祖先信息(例如群体遗传成分分析)来推测供者的群体来源,这会对案件的侦破能起到指导性作用。在不同人群中等位基因频率差异显著的SNP位点可以作为AISNPs,使用一组AISNPs位点对不同人群的遗传成分构成进行分析以实现人群的区分。
中国青藏高原藏族群体作为东亚亚人群久居于海拔3000~5000米的青藏高原,经过长期的自然选择形成了独特的高原适应机制,该机制与基因EGLN1、EPAS1等有关,这些基因上存在大量的单核苷酸多态性位点(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)。杨鑫等对EPAS1和EGLN1基因上的10个SNPs位点进行遗传多态性分析,发现4个SNPs位点(rs150877473、rs1562453、rs186996510、rs7589621)在藏汉人群中存在显著差异。然而,目前还没有有效的能够实现在非洲、美洲、欧洲、南亚、东亚人群中识别来自中国青藏高原藏族群体的个体的方法。
如何提供一种有效的能在非洲、美洲、欧洲、南亚、东亚人群中识别个体是否为中国青藏高原藏族群体个体的方法或系统成为有待解决的问题。
发明内容
本发明提供了一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法,通过获得所述个体的DNA的87个藏族特异高原适应SNP位点的基因型,结合STRUCTURE软件获得所述个体的群体遗传成分分析结果,根据该结果识别该个体是否为中国青藏高原藏族群体个体。
本发明还提供了一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的系统,利用该系统中的复合扩增检测体系能快速获得所述个体的DNA 87个藏族特异高原适应SNP位点的基因型,进而与现有软件结合,获得所述个体的群体遗传成分分析结果,根据该结果识别该个体是否为中国青藏高原藏族群体个体。
本发明还提供了一种复合扩增检测体系,能快速得到个体的DNA 87个藏族特异高原适应SNP位点的基因型,为获得所述个体的遗传成分分析结果提供数据支持。
本发明还提供了一种检测试剂盒,含有所述复合扩增检测体系。该试剂盒能快速获得个体的DNA 87个藏族特异高原适应SNP位点的基因型。
本发明提供的一种在27个群体中识别中国青藏高原藏族群体个体的方法,该方法包括:
1)提取个体的DNA;
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