[发明专利]一种与乳腺癌化疗毒性相关的SNP标志物及其应用

说明书

本发明涉及在成纤维细胞生长因子受体(FGFR)基因上的2个与乳腺癌相关联的单核苷酸多态性(SNP)位点rs2420946和rs2981578，预测乳腺癌化疗毒性。本发明通过SNP生物标志物和乳腺癌化疗毒性诊断试剂盒的研制和应用，对乳腺癌化疗后毒性反应程度进行预测，从而指导肿瘤化疗用药、为临床医生预测患者预后提供新的途径。

技术领域

本发明涉及基因工程与肿瘤学技术领域，具体地，本发明涉及一种与乳腺癌化疗毒性相关的SNP标志物及其应用。

背景技术

乳腺癌是一种严重危害女性身心健康的常见恶性肿瘤，发病率和死亡率逐年上升，全球每年有120万妇女患乳腺癌，50万妇女死于乳腺癌。化学治疗已与手术治疗、放射治疗一样成为肿瘤治疗的主要手段。随着化疗药物的不断更新，乳腺癌在化学治疗方面已取得了令人瞩目的进展。紫杉醇类和蒽环类药物经过多年的临床实践已成为乳腺癌化疗的两大基石,广泛用于一线和二线局部晚期以及复发、转移性乳腺癌的治疗，规范的治疗能明显改善乳腺癌的预后。但在临床实践和研究中也发现，乳腺癌的化疗疗效、毒副反应存在个体差异，紫杉醇单药用于一线治疗的有效率为32-62％，多西紫杉醇用于转移性乳腺癌的治疗反应率为30-50％。

因此，从药物遗传学和药物基因组学角度研究患者之间药物敏感性的差异，寻找可靠的预测指标，指导个体化治疗，对于指导个体化治疗、改善患者的预后，提高临床用药的有效性和安全性具有极其重要的意义。同时也为研究不同患者之间药物敏感性方面的差异开辟了新的途径。

研究表明，单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism，SNP)是引起药物毒副反应的重要遗传因素。SNP是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，它是人类最常见的可遗传变异，在人类基因组中广泛存在。SNP表现出的多态性仅涉及到单个碱基的变异，表现是有转换、颠换、插入和缺失等。单核苷酸多态性为第三代遗传标志，人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。目前对于不同分型乳腺癌预后、疗效的预测性研究主要集中在SNP水平。近年来，利用SNP诊断疾病的发生发展已成为临床和科研工作者的研究热点。然而，目前还没有将SNP应用于乳腺癌化疗药物毒性辅助诊断的报道，若能筛选出乳腺癌易感的SNP作为生物标志物，研究其在辅助诊断乳腺癌化疗药物毒性方面的作用，并研制相应的诊断试剂盒，必将有力地推动我国乳腺癌预后评价的现状，并为化疗药物筛选、药效评价及靶向治疗开辟新的途径。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术中的缺陷，提供一种与乳腺癌化疗毒性相关的SNP标志物及其应用，通过对成纤维细胞生长因子受体(FGFR)基因上的单核苷酸多态性位点遗传特异性的研究，提出两个可作为辅助诊断乳腺癌化疗药物毒性的SNP位点，以用于指导肿瘤化疗用药。

为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

本发明的第一个目的是提供一种与乳腺癌化疗毒性相关的SNP标志物，其包括FGFR2基因上的rs2420946、FGFR2基因上的rs2981578中的至少一种。

本发明的第二个目的是提供一种上述SNP标志物的特异性扩增引物，该特异性引物是指针对上述两个基因多态位点而设计，能特异性扩增出包含这2个SNP位点中的至少一个的DNA片段的引物对。特异性引物对可用常规的合成技术进行合成。SNP标志物的特异性扩增引物包括rs2420946的扩增引物、rs2981578的扩增引物中的至少一种；其中，rs2420946的扩增引物序列为SEQ ID No：1和SEQ ID No：2，rs2981578的扩增引物序列为SEQ ID No：3和SEQ ID No：4。

上述SNP位点：rs2420946和rs2981578的引物信息如下表所示：

表1.相关SNP位点的引物信息