[发明专利]用于鉴定桉树无性系的STR引物及其应用有效
申请号: | 201710671363.1 | 申请日: | 2017-08-08 |
公开(公告)号: | CN107385052B | 公开(公告)日: | 2020-10-30 |
发明(设计)人: | 周长品;李昌荣;李发根;翁启杰;陈升侃;王莉;甘四明 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院热带林业研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510520 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 桉树 无性 str 引物 及其 应用 | ||
1.用于鉴定桉树无性系的STR引物在鉴定桉树无性系中的应用,其特征在于,包括以下步骤:
a. 提取待测桉树DNA;
b. 以步骤a提取的桉树DNA为模板,以用于鉴定桉树无性系的STR引物进行多重PCR扩增,得到PCR产物;
所述的用于鉴定桉树无性系的STR引物,包括以下8对引物:
EUCeSSR0475引物:其正向引物如SEQ ID NO.1所示,其反向引物如SEQ ID NO.2所示;
EUCeSSR0204引物:其正向引物如SEQ ID NO.3所示,其反向引物如SEQ ID NO.4所示;
EUCeSSR419引物:其正向引物如SEQ ID NO.5所示,其反向引物如SEQ ID NO.6所示;
EUCeSSR1128引物:其正向引物如SEQ ID NO.7所示,其反向引物如SEQ ID NO.8所示;
EUCeSSR298引物:其正向引物如SEQ ID NO.9所示,其反向引物如SEQ ID NO.10所示;
EUCeSSR0176引物:其正向引物如SEQ ID NO.11所示,其反向引物如SEQ ID NO.12所示;
EUCeSSR181引物:其正向引物如SEQ ID NO.13所示,其反向引物如SEQ ID NO.14所示;
EUCeSSR304引物:其正向引物如SEQ ID NO.15所示,其反向引物如SEQ ID NO.16所示;
荧光物质加在正向引物的5'端,EUCeSSR0475引物对、EUCeSSR0204引物对、EUCeSSR419引物对、EUCeSSR1128引物对、EUCeSSR298引物对、EUCeSSR0176引物对、EUCeSSR181引物对、EUCeSSR304引物对标记的荧光物质依次分别是ROX、6-FAM、TAMRA、ROX、TAMRA、6-FAM、HEX、ROX;
所述的多重PCR扩增,其反应体系为:2x Type-it Multiplex PCR Master Mix 5 μL,RNase-Free Water 1 μL,Primers 2 μL,30 ng/μL的 Template DNA 2 μL;其中Primers包含的各引物在反应体系中的终浓度为:EUCeSSR0475的正向、反向引物各为0.17 μM,EUCeSSR0204的正向、反向引物各为0.05 μM,EUCeSSR419的正向、反向引物各为0.15 μM,EUCeSSR1128的正向、反向引物各为0.33 μM,EUCeSSR298的正向、反向引物各为0.19 μM,EUCeSSR0176的正向、反向引物各为0.06 μM,EUCeSSR181的正向、反向引物各为0.17 μM,EUCeSSR304的正向、反向引物各为0.87 μM;
所述的多重PCR扩增,其反应程序为:95 ℃预变性 5 min ;95 ℃变性 30s、 60 ℃退火 90s、72 ℃延伸 30 s,30 个循环;60 ℃延伸30 min;20 ℃保温;
c. 对PCR产物进行分型,与桉树无性系STR指纹图谱进行比对,确定待测桉树的品种。
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