[发明专利]一种组蛋白免疫共沉淀(ChIP)试剂配方在审
| 申请号: | 201710660025.8 | 申请日: | 2017-08-04 |
| 公开(公告)号: | CN109387623A | 公开(公告)日: | 2019-02-26 |
| 发明(设计)人: | 李旦 | 申请(专利权)人: | 苏州同因生物科技有限公司 |
| 主分类号: | G01N33/531 | 分类号: | G01N33/531;G01N33/543 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 215500 江苏省苏州市常熟高新技*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 组蛋白 免疫共沉淀 试剂配方 实例研究 基因型 配方 检测 保证 | ||
本发明涉及一种组蛋白免疫共沉淀(ChIP)试剂配方,包含五步,本发明的有益成果为:本发明提供的一种组蛋白免疫共沉淀试剂配方,本发明的方法在经过实例研究后。本发明的配方会综合被检测者基因型和组蛋白信息,通过复杂的步骤保证试剂的质量。
技术领域
本发明涉及医学领域,涉及一种组蛋白免疫共沉淀(ChIP)试剂配方。
背景技术
免疫共沉淀(ChIP)是一种能真实反映细胞内组蛋白与DNA相互作用的实验技术。其原理是利用抗原抗体反应,通过用特异性抗体将目的蛋白及与之结合的DNA共同沉淀下来,再采用PCR、蛋白质分析技术、生物芯片技术等对目的DNA片段进行分析。组蛋白免疫共沉淀是表观遗传学研究的主要内容。
发明内容
有鉴于此,本发明提供一种解决或部分解决上述问题的组蛋白免疫共沉淀(ChIP)试剂配方。
为达到上述技术方案的效果,本发明的技术方案为:一种组蛋白免疫共沉淀(ChIP)试剂配方,包含:
(1)进行蛋白-DNA交联和裂解细胞:用终浓度为1%甲醛溶液固定总数为1×107的K562细胞,室温下放置10min,甘氨酸溶液中止反应;用预冷的PBS洗涤细胞两次,离心去上清后加入1ml含蛋白酶抑制剂的SDS裂解液裂解细胞;
(2)超声断裂染色质:按优化好的条件(100W,每次超声10s,共5次,间隔30s)断裂细胞裂解液中的染色质,4℃下离心后保留上清;
(3)免疫共沉淀:超声处理后的溶液中加入蛋白G-琼脂糖小珠进行预清除,离心后吸取1%(v/v)上清留作Input溶液在剩余的上清中加入免疫共沉淀抗体,包括阳性对照抗体(anti-RNA Polymerase II,1.0μg/管)、阴性对照抗体(normal mouse IgG,1.0μg/管)和目的抗体(依抗体说明书推荐量:抗ac H3抗体10μg/管,抗ac H4抗体3μg/管),在4℃摇床上孵育过夜,次日溶液中加入蛋白G-琼脂糖小珠吸附免疫沉淀复合物,短暂离心后去上清,顺次用低盐、高盐、氯化锂和TE缓冲液清洗蛋白G-琼脂糖小珠;
(4)免疫沉淀复合物洗脱:用洗脱缓冲液洗脱免疫沉淀复合物,同时在装有Input溶液的管中加入相同体积的洗脱缓冲液;
(5)蛋白-DNA结合物解交联,释放DNA:加入5mol/L Na Cl溶液,65℃水浴孵育4-5h或过夜;
(6)用DNA纯化柱回收DNA。
本发明的有益成果为:本发明提供的一种组蛋白免疫共沉淀试剂配方,本发明的方法在经过实例研究后。本发明的配方会综合被检测者基因型和组蛋白信息,通过复杂的步骤保证试剂的质量。
具体实施方式
为了使本发明所要解决的技术问题、技术方案及有益效果更加清楚明白,以下结合实施例,对本发明进行详细的说明。应当说明的是,此处所描述的具体实施例仅用以解释本发明,并不用于限定本发明,能实现同样功能的产品属于等同替换和改进,均包含在本发明的保护范围之内。具体方法如下:
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