[发明专利]一种预测待测猪的窝产活仔数遗传性能的SNP位点组合及方法有效
| 申请号： | 201710629681.1 | 申请日： | 2017-07-28 |
| 公开（公告）号： | CN107287329B | 公开（公告）日： | 2021-02-09 |
| 发明（设计）人： | 苗泽圃;郑华;魏强;李勇;杨漫漫;陈茜;蒙小云;方铭;陈涛 | 申请（专利权）人： | 深圳华大生命科学研究院;深圳市农牧实业有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;G16B20/30;G16B25/00 |
| 代理公司： | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人： | 关畅 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 预测 待测猪 窝产活仔数 遗传 性能 snp 组合 方法 | ||
1.预测待测猪的窝产活仔数遗传性能的系统，包括检测待测猪的SNP位点组合中各个SNP位点的基因型的试剂；
所述SNP位点组合，由SNP1位点、SNP2位点、SNP3位点、SNP4位点和SNP5位点组成；
所述SNP1位点为猪基因组中序列表中序列1自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP2位点为猪基因组中序列表中序列2自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP3位点为猪基因组中序列表中序列3自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP4位点为猪基因组中序列表中序列4自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP5位点为猪基因组中序列表中序列5自5’末端起第501位核苷酸。
2.如权利要求1所述的系统，其特征在于：所述系统还包括将待测猪的所述SNP位点组合中各个SNP位点的基因型转换为待测猪的所述SNP位点组合的效应值的系统。
3.检测SNP位点组合中各个SNP位点基因型的试剂在预测待测猪的窝产活仔数遗传性能中的应用；
所述SNP位点组合，由SNP1位点、SNP2位点、SNP3位点、SNP4位点和SNP5位点组成；
所述SNP1位点为猪基因组中序列表中序列1自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP2位点为猪基因组中序列表中序列2自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP3位点为猪基因组中序列表中序列3自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP4位点为猪基因组中序列表中序列4自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP5位点为猪基因组中序列表中序列5自5’末端起第501位核苷酸。
4.权利要求1或2所述系统在预测待测猪的窝产活仔数遗传性能中的应用。
5.检测分子标记甲的试剂在预测待测猪的窝产活仔数遗传性能中的应用；
所述分子标记甲为SNP1位点；
所述SNP1位点为猪基因组中序列表中序列1自5’末端起第501位核苷酸。
6.一种预测待测猪的窝产活仔数遗传性能的方法，依次包括如下步骤：
（1）检测待测猪的SNP位点组合中各个SNP位点的基因型；
所述SNP位点组合，由SNP1位点、SNP2位点、SNP3位点、SNP4位点和SNP5位点组成；
所述SNP1位点为猪基因组中序列表中序列1自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP2位点为猪基因组中序列表中序列2自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP3位点为猪基因组中序列表中序列3自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP4位点为猪基因组中序列表中序列4自5’末端起第501位核苷酸；
所述SNP5位点为猪基因组中序列表中序列5自5’末端起第501位核苷酸；
（2）采用MBLUP模型估计待测猪SNP位点组合的效应值，SNP位点组合的效应值越大，其窝产活仔数的遗传性能越高；SNP位点组合的效应值越小，其窝产活仔数的遗传性能越低。
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