[发明专利]单分子的识别、计数方法及装置在审
申请号: | 201710607586.1 | 申请日: | 2017-07-24 |
公开(公告)号: | CN108229098A | 公开(公告)日: | 2018-06-29 |
发明(设计)人: | 徐伟彬;金欢;颜钦;姜泽飞 | 申请(专利权)人: | 深圳市瀚海基因生物科技有限公司 |
主分类号: | G06F19/16 | 分类号: | G06F19/16;G06F19/18;G06K9/00 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 张润 |
地址: | 518000 广东省深圳市南山区西丽街道*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 单分子 网格 连通区域 时间序列 线段 计数方法及装置 计数装置 输入图像 图像处理 线段组成 游程编码 阵列排布 线腐蚀 直方图 判定 图像 转换 转化 统计 | ||
1.一种单分子的识别方法,其特征在于,包括步骤:
输入图像亮点强度的时间序列;
根据所述时间序列,形成所述图像亮点的时间与强度的折线图,所述折线图由多条线段组成;
对所述折线图进行网格划分以形成阵列排布的多个网格,统计落在每个所述网格的所述线段和/或所述线段的端点的次数;
根据每个所述网格所对应的所述次数,对进行网格划分后的所述折线图进行线腐蚀以将进行网格划分后的所述折线图转换为简化图;
对所述简化图进行游程编码以标识连通区域;
计算每个所述连通区域的面积,判定满足以下条件的一个所述连通区域对应一个单分子:所述连通区域的面积大于第一设定阈值;
任选的,
还包括步骤:
基于所述强度的大小进行分组,对所述次数进行频数统计,以获得直方图;
查找所述直方图的极大值点,判定满足以下条件的一个极大值点所在的峰对应一个单分子:所述极大值点的值大于第二设定阈值且所述极大值点所在的峰的宽度大于第三设定阈值。
2.一种单分子的计数方法,其特征在于,包括步骤:
输入图像亮点强度的时间序列;
根据所述时间序列,形成所述图像亮点的时间与强度的折线图,所述折线图由多条线段组成;
对所述折线图进行网格划分以形成阵列排布的多个网格,统计落在每个所述网格的所述线段和/或所述线段的端点的次数;
根据每个所述网格所对应的所述次数,对进行网格划分后的所述折线图进行线腐蚀以将进行网格划分后的所述折线图转换为简化图;
对所述简化图进行游程编码以标识连通区域;
计算每个所述连通区域的面积,判定满足以下条件的一个所述连通区域对应一个单分子:所述连通区域的面积大于第一设定阈值;
计算获得单分子的数目S2;
任选的,
还包括步骤:
基于所述强度的大小进行分组,对所述次数进行频数统计,以获得直方图;
查找所述直方图的极大值点,判定满足以下条件的一个极大值点所在的峰对应一个单分子:所述极大值点的值大于第二设定阈值且所述极大值点所在的峰的宽度大于第三设定阈值;
计算获得单分子的数目S1,取S1和S2中的较小者作为最终单分子数。
3.一种单分子的计数方法,其特征在于,包括步骤:
输入图像亮点强度的时间序列;
根据所述时间序列,形成所述图像亮点的时间与强度的折线图,所述折线图由多条线段组成;
对所述折线图进行网格划分以形成阵列排布的多个网格,统计落在每个所述网格的所述线段和/或所述线段的端点的次数;
根据每个所述网格所对应的所述次数,对进行网格划分后的所述折线图进行线腐蚀以将进行网格划分后的所述折线图转换为简化图;
对所述简化图进行游程编码以标识连通区域;
计算每个所述连通区域的面积,并判定满足以下条件时,对单分子的计数加1:所述连通区域的面积大于第一设定阈值;
任选的,
还包括步骤:
基于所述强度的大小进行分组,对所述次数进行频数统计,以获得直方图;
查找所述直方图的极大值点,判定满足以下条件时,对单分子的计数加1:所述极大值点的值大于第二设定阈值且所述极大值点所在的峰的宽度大于第三设定阈值;
将基于所述直方图获取的单分子的计数和基于所述游程编码获取的单分子的计数中的较小者作为最终的单分子数。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳市瀚海基因生物科技有限公司,未经深圳市瀚海基因生物科技有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201710607586.1/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:单分子的识别、计数方法及装置
- 下一篇:数据处理方法、装置、存储介质及处理器
- 同类专利
- 专利分类
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用