[发明专利]单分子的识别、计数方法及装置在审

专利信息
申请号: 201710607586.1 申请日: 2017-07-24
公开(公告)号: CN108229098A 公开(公告)日: 2018-06-29
发明(设计)人: 徐伟彬;金欢;颜钦;姜泽飞 申请(专利权)人: 深圳市瀚海基因生物科技有限公司
主分类号: G06F19/16 分类号: G06F19/16;G06F19/18;G06K9/00
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 代理人: 张润
地址: 518000 广东省深圳市南山区西丽街道*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 单分子 网格 连通区域 时间序列 线段 计数方法及装置 计数装置 输入图像 图像处理 线段组成 游程编码 阵列排布 线腐蚀 直方图 判定 图像 转换 转化 统计
【权利要求书】:

1.一种单分子的识别方法,其特征在于,包括步骤:

输入图像亮点强度的时间序列;

根据所述时间序列,形成所述图像亮点的时间与强度的折线图,所述折线图由多条线段组成;

对所述折线图进行网格划分以形成阵列排布的多个网格,统计落在每个所述网格的所述线段和/或所述线段的端点的次数;

根据每个所述网格所对应的所述次数,对进行网格划分后的所述折线图进行线腐蚀以将进行网格划分后的所述折线图转换为简化图;

对所述简化图进行游程编码以标识连通区域;

计算每个所述连通区域的面积,判定满足以下条件的一个所述连通区域对应一个单分子:所述连通区域的面积大于第一设定阈值;

任选的,

还包括步骤:

基于所述强度的大小进行分组,对所述次数进行频数统计,以获得直方图;

查找所述直方图的极大值点,判定满足以下条件的一个极大值点所在的峰对应一个单分子:所述极大值点的值大于第二设定阈值且所述极大值点所在的峰的宽度大于第三设定阈值。

2.一种单分子的计数方法,其特征在于,包括步骤:

输入图像亮点强度的时间序列;

根据所述时间序列,形成所述图像亮点的时间与强度的折线图,所述折线图由多条线段组成;

对所述折线图进行网格划分以形成阵列排布的多个网格,统计落在每个所述网格的所述线段和/或所述线段的端点的次数;

根据每个所述网格所对应的所述次数,对进行网格划分后的所述折线图进行线腐蚀以将进行网格划分后的所述折线图转换为简化图;

对所述简化图进行游程编码以标识连通区域;

计算每个所述连通区域的面积,判定满足以下条件的一个所述连通区域对应一个单分子:所述连通区域的面积大于第一设定阈值;

计算获得单分子的数目S2;

任选的,

还包括步骤:

基于所述强度的大小进行分组,对所述次数进行频数统计,以获得直方图;

查找所述直方图的极大值点,判定满足以下条件的一个极大值点所在的峰对应一个单分子:所述极大值点的值大于第二设定阈值且所述极大值点所在的峰的宽度大于第三设定阈值;

计算获得单分子的数目S1,取S1和S2中的较小者作为最终单分子数。

3.一种单分子的计数方法,其特征在于,包括步骤:

输入图像亮点强度的时间序列;

根据所述时间序列,形成所述图像亮点的时间与强度的折线图,所述折线图由多条线段组成;

对所述折线图进行网格划分以形成阵列排布的多个网格,统计落在每个所述网格的所述线段和/或所述线段的端点的次数;

根据每个所述网格所对应的所述次数,对进行网格划分后的所述折线图进行线腐蚀以将进行网格划分后的所述折线图转换为简化图;

对所述简化图进行游程编码以标识连通区域;

计算每个所述连通区域的面积,并判定满足以下条件时,对单分子的计数加1:所述连通区域的面积大于第一设定阈值;

任选的,

还包括步骤:

基于所述强度的大小进行分组,对所述次数进行频数统计,以获得直方图;

查找所述直方图的极大值点,判定满足以下条件时,对单分子的计数加1:所述极大值点的值大于第二设定阈值且所述极大值点所在的峰的宽度大于第三设定阈值;

将基于所述直方图获取的单分子的计数和基于所述游程编码获取的单分子的计数中的较小者作为最终的单分子数。

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