[发明专利]微卫星标记及其在结直肠癌的预后判定和/或化疗敏感性预测中的应用

说明书

本申请涉及微卫星标记及其在结直肠癌的预后判定和/或化疗敏感性预测中的应用。所述微卫星标记选自如SEQ ID Nos.1‑20所示的核苷酸序列中的至少一种。另外，本申请还公开了微卫星标记组合，包括如SEQ ID Nos.1‑5和SEQ ID Nos.61‑63所示的核苷酸序列；和/或所述组合包括SEQ ID No.4和/或SEQ ID No.6所示的核苷酸序列。这些微卫星位点组合将为中国人群的结直肠癌患者的预后判定和/或中国人群的结直肠癌患者的化疗应答提供更为有力的工具。

技术领域

本申请涉及一种微卫星标记，特别是相关的微卫星标记及组合在结直肠癌的预后判定和/或化疗敏感性预测中的应用。

背景技术

微卫星(Microsatellite,MS)(又称之为短串联重复(short tandem repeat,STR)序列)，是以1-6个碱基为单位的DNA重复序列，其在动植物中具有高度的多态性。微卫星位点随机地分布在整个真核生物基因组中。由于微卫星在哺乳动物基因组中随机的高频多态性而被视为重要的DNA标记物。微卫星在DNA复制过程中极易发生滑动，导致其长度的变化，这种现象称为微卫星不稳定性(Microsatellite instability，MSI)。多种癌症都存在微卫星不稳定性现象，例如结直肠癌，子宫内膜癌，胃癌，胶质瘤，肺癌，乳腺癌，淋巴瘤和卵巢癌等。事实上，MSI已被视为结直肠癌预后以及生存期的一个有价值的标志物。

结直肠癌是西方发达国家，中国和其他国家都最为常见的肿瘤之一，根据中国国家癌症中心的数据，胃癌和结直肠癌是中国男性和女性最常见的癌症，无论是男性还是女性患者，结直肠癌都是癌症致死的前5位因素之一。研究表明西方国家有80％的结直肠癌表现出染色体不稳定性(chromosome instability,CIN)，15％表现为微卫星不稳定性。在我国，14.3％的结直肠癌患者表现出微卫星不稳定。这表明MSI表型与结直肠癌密切相关。美国国家癌症中心就推荐Bethesda位点组合(包括单核苷酸重复BAT25和BAT26以及二核苷酸重复D2S123，D5S346和D17S250)以及修订后的Bethesda位点组合(包括5个单核苷酸重复)在临床上用于MSI的检测。近期国外的研究表明，Bethesda位点组合似乎是预后较好以及更长无病生存期的一个好的生物标记物。然而，这一结论主要是基于西方人群得出的结论。

临床研究进一步证实同一种癌症存在着不同的临床病理学特征和基因突变谱以及化疗应答的差异性，而且，较为重要的是，不同人种和不同地区的同一种肿瘤的发生发展、基因突变谱和机制也不尽相同。我国结直肠癌患者与西方国家的患者就存在一些差异，如西方国家所有结直肠癌患者和MSI-H(高频微卫星不稳定性)结直肠癌患者中BRAFV600E突变率分别为3.7％-20.6％和18.4％-70.8％，而在东亚国家患者中该比例较低，分别为0.7％-11.4％和6.2％-45.7％。

因此，在我国迫切需要开展结直肠癌临床预后判定、化疗敏感性预测分子生物学标记物，特别是针对中国人群的结直肠癌临床预后判定、化疗敏感性预测分子生物学标记物。

发明内容

基于现有技术中存在的问题，本申请以中国人群为研究对象，对中国人群中患有结直肠癌的样本检测MSI发生情况，筛选并提出更适合预后判定和/或化疗敏感性预测(例如化疗药物应答评估)的微卫星标记位点及其组合。

本申请之一提供了一种微卫星标记，所述微卫星标记选自如SEQ ID Nos.1-20所示的核苷酸序列中的至少一种。

本申请之二提供了一种微卫星标记组合，所述组合包括如SEQ ID Nos.1-5和SEQID Nos.61-63所示的核苷酸序列；优选所述组合包括如SEQ ID Nos.1-5和SEQ ID No.61所示的核苷酸序列中的至少两种。例如，在一个最优选的实施方式中，所述组合包括如SEQ IDNos.1-5和SEQ ID No.61所示的核苷酸序。和/或