[发明专利]一种基因编辑系统及应用其对植物基因组进行编辑的方法有效

专利信息
申请号: 201710599030.2 申请日: 2017-07-21
公开(公告)号: CN107338265B 公开(公告)日: 2020-02-18
发明(设计)人: 韩方普;冯超;王锐;柏晗;袁静;张晶;苏汉东;刘亚林;郭宪瑞 申请(专利权)人: 中国科学院遗传与发育生物学研究所
主分类号: C12N15/82 分类号: C12N15/82;C12N15/66;C12N9/22;A01H5/00;C12N1/21;A01H6/46
代理公司: 中科专利商标代理有限责任公司 11021 代理人: 任岩
地址: 100101 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 基因 编辑 系统 应用 植物 基因组 进行 方法
【权利要求书】:

1.一种基因编辑系统,其包括sgRNA转录单元,以及由顺次连接的来源于玉米的DMC1基因启动子和Cas9基因组成的DMC1p-Cas9转录单元,其中,sgRNA识别的靶位点符合5’-Nx-NGG-3’或者5’-CCN-Nx-3’序列规则,N代表A、T、C和G中的任何一种,14≤X≤30,且X为整数,NX表示X个连续的脱氧核糖核苷酸。

2.根据权利要求1所述的基因编辑系统,其中,所述DMC1基因启动子的序列如SEQ IDNO.1所示。

3.一种包括如权利要求1或2所述的基因编辑系统的重组载体。

4.权利要求3所述重组载体的构建方法,其包括如下步骤:

(1)克隆获得DMC1基因启动子并将其与Cas9基因顺次连接,组成DMC1p-Cas9转录单元;

(2)构建识别靶位点的sgRNA转录单元,并将DMC1p-Cas9转录单元和sgRNA转录单元同时导入双元载体,得到重组载体,其中,sgRNA识别的靶位点符合5’-Nx-NGG-3’或者5’-CCN-Nx-3’序列规则,N代表A、T、C和G中的任何一种,14≤X≤30,且X为整数,NX表示X个连续的脱氧核糖核苷酸。

5.根据权利要求4所述的构建方法,步骤(1)中,所述DMC1基因启动子的序列如SEQ IDNO.1所示。

6.根据权利要求5所述的构建方法,步骤(1)中,克隆获得DMC1基因启动子采用如下方法:以玉米B73的基因组DNA为模板,以序列如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的引物为扩增引物对模板进行PCR反应,扩增得到序列如SEQ ID NO.1所示的片段,即为DMC1基因启动子。

7.根据权利要求4所述的构建方法,步骤(1)中,在克隆获得DMC1基因启动子之后,所述将其与Cas9基因顺次连接采用如下方法:将得到的DMC1基因启动子替换35S-Cas9-SK载体中的35S启动子,得到pDMC1-Cas9-SK重组载体,再利用Xma I和EcoR I两个酶切位点将DMC1p-Cas9转录单元转移到双元载体pTF101.1,得到重组载体pDMC1-Cas9。

8.根据权利要求7所述的构建方法,步骤(2)采用如下操作:将符合5’-Nx-NGG-3’或者5’-CCN-Nx-3’序列规则的靶位点的DNA序列通过引物退火连入pU3-sgRNA载体中,然后通过Hind III酶切位点将sgRNA的转录单元亚克隆到重组载体pDMC1-Cas9中,得到包括sgRNA转录单元,以及由顺次连接的来源于玉米的DMC1基因启动子和Cas9基因组成的DMC1p-Cas9转录单元的重组载体。

9.一种包括权利要求3所述重组载体的基因工程菌。

10.一种应用权利要求1所述的基因编辑系统对植物基因组进行编辑的方法,其包括:将权利要求9所述的基因工程菌转化受体植物组织,获得被编辑的转基因植物材料。

11.根据权利要求10所述的方法,其中,所述植物为单子叶植物。

12.根据权利要求11所述的方法,其中,所述植物为玉米或小麦。

13.根据权利要求10-12中任一项所述的方法,其中,所述受体植物组织为未成熟的幼胚。

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