[发明专利]一种检测黄瓜花叶病毒的LAMP引物组、试剂盒及检测方法在审

专利信息
申请号: 201710590061.1 申请日: 2017-07-19
公开(公告)号: CN107177700A 公开(公告)日: 2017-09-19
发明(设计)人: 赵凯;蔡友铭;张永春;范小瑞;赵笑;杨丹;梁洁玲;杜亚楠;赵庆;史斌;赵桓震;赵斌安;潘磊;张琪;张晓霞 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/94
代理公司: 上海开祺知识产权代理有限公司31114 代理人: 张晓敏,费开逵
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
权利要求书: 查看更多 说明书: 查看更多
摘要:
搜索关键词: 一种 检测 黄瓜花叶病毒 lamp 引物 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种用于检测黄瓜花叶病毒的LAMP引物组,其包括外引物F3和B3,内引物FIP和BIP,从5'端到3'端,具体序列如下:

F3:5'-CCACCCAACCTTTGTAGG-3';

B3:5'-CGGCAAAGGATTAACTCGA-3';

FIP:5'-GTCTATTTTTGGTGGCTTTAGGGTTTTTGAGTGAACGCTGTAAACCT-3';

BIP:5'-CGTGGGTCTTATTATGGTAAAAGGTTTTTATTTGAATGCGCGAAACA-3'。

2.一种包含权利要求1所述LAMP引物组的黄瓜花叶病毒的LAMP检测试剂盒。

3.根据权利要求2所述黄瓜花叶病毒的LAMP检测试剂盒,其特征在于,其包含LAMP反应体系,该LAMP反应体系包括:内引物FIP、内引物BIP、外引物F3、外引物B3、10×buffer、Mg2+、dNTPs、甜菜碱和Bst DNA聚合酶,其中,内引物与外引物的浓度之比为8-16:1。

4.根据权利要求3所述黄瓜花叶病毒的LAMP检测试剂盒,其特征在于,所述的LAMP反应体系中,各成分的终浓度为:内引物FIP 0.8-1.6μM,内引物BIP 0.8-1.6μM,外引物F3 0.1-0.2μM,外引物B3 0.1-0.2μM,Mg2+1.0-2.0mM,dNTPs 0.2-0.3mM,甜菜碱0.6-1.0M,Bst DNA聚合酶0.26-0.38U/μL,其中,内引物与外引物的浓度比为8-16:1。

5.根据权利要求3所述黄瓜花叶病毒的LAMP检测试剂盒,其特征在于,LAMP反应体系中,各成分的终浓度为:内引物FIP:1.2-1.6μM,内引物BIP:1.2-1.6μM,外引物F3:0.12-0.2μM,外引物B3:0.12-0.2μM,Mg2+1.3-1.7mM,dNTPs 0.25-0.3mM,甜菜碱0.6-0.8M,Bst DNA聚合酶0.32-0.38U/μL,其中,内引物与外引物的浓度比为8-16:1。

6.根据权利要求3所述黄瓜花叶病毒的LAMP检测试剂盒,其特征在于,LAMP反应体系中,各成分的终浓度为:内引物FIP 1.6μM,内引物BIP 1.6μM,外引物F3 0.2μM,外引物B3 0.2μM,Mg2+1.5mM,dNTPs 0.3mM,甜菜碱0.6M,Bst酶0.38U/μL。

7.一种黄瓜花叶病毒的LAMP快速检测方法,包括以下步骤:

1)提取待测样品RNA,将总RNA的50ng-5μg用全式基因逆转录试剂盒进行逆转录,获得cDNA;

2)配制LAMP反应体系;

以ddH2O为阴性对照,以包含黄瓜花叶病毒目的序列的质粒为阳性对照,配制LAMP反应体系;

所述LAMP反应体系中,各成分的终浓度为:内引物FIP 0.8-1.6μM,内引物BIP 0.8-1.6μM,外引物F3 0.1-0.2μM,外引物B3 0.1-0.2μM,10×buffer,MgCl2 1.0-2.0mM,dNTPs 0.2-0.3mM,甜菜碱0.6-1M,Bst DNA聚合酶0.26-0.38U/μL,逆转录得到的cDNA模板1μL,其中,内引物与外引物的浓度比为8-16:1;

3)进行LAMP扩增反应

LAMP扩增反应程序为:55-63℃30-60min,80-85℃3-5min;

4)鉴定扩增结果

步骤3)LAMP扩增反应结束后,向扩增产物中加入显色剂SYBR Green I染料,观察颜色变化:显色为绿色的样品为阳性,含有黄瓜花叶病毒;显色为橘色的样品为阴性,不含黄瓜花叶病毒;

或者取LAMP扩增产物,在Goldview染色的琼脂糖凝胶上进行电泳,在凝胶成像仪器的紫外光下显影观察,若出现特征性的梯状条带则样品为阳性,含有黄瓜花叶病毒;若无条带出现则样品为阴性,不含黄瓜花叶病毒。

下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。

该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海市农业科学院,未经上海市农业科学院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服

本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201710590061.1/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。

×

专利文献下载

说明:

1、专利原文基于中国国家知识产权局专利说明书;

2、支持发明专利 、实用新型专利、外观设计专利(升级中);

3、专利数据每周两次同步更新,支持Adobe PDF格式;

4、内容包括专利技术的结构示意图流程工艺图技术构造图

5、已全新升级为极速版,下载速度显著提升!欢迎使用!

请您登陆后,进行下载,点击【登陆】 【注册】

关于我们 寻求报道 投稿须知 广告合作 版权声明 网站地图 友情链接 企业标识 联系我们

钻瓜专利网在线咨询

周一至周五 9:00-18:00

咨询在线客服咨询在线客服
tel code back_top