[发明专利]一种作为分子标记的与猪胴体性状相关的14-3-3ζ基因片段的克隆与应用有效

专利信息
申请号: 201710575709.8 申请日: 2017-07-14
公开(公告)号: CN107130056B 公开(公告)日: 2020-10-30
发明(设计)人: 徐永杰;张朋朋;徐海霞;李瑞;张凯丽;王素莹;吴伟 申请(专利权)人: 信阳师范学院
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6806;C12N15/11;C12N15/10
代理公司: 郑州大通专利商标代理有限公司 41111 代理人: 陈勇
地址: 464000 河*** 国省代码: 河南;41
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摘要:
搜索关键词: 一种 作为 分子 标记 胴体 性状 相关 14 基因 片段 克隆 应用
【权利要求书】:

1.14-3-3ζ基因片段在猪胴体性状分子标记辅助选择中的应用,其特征在于,所述14-3-3ζ基因片段的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:3所示,所述猪胴体性状为皮率、瘦肉率、肥瘦肉比例和眼肌面积。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述序列表SEQ ID NO:3的长度为2050bp,在序列表SEQ ID NO:3第938bp处为T938C的碱基突变,导致BstxIPCR-RFLP多态性。

3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,检测所述碱基突变的引物对的DNA序列如下所示:

正向引物:5' TGCCTGATAATTGGTAT 3';

反向引物:5' TTAGCGTGCTGTCTTTGT 3'。

4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述14-3-3ζ基因片段的克隆方法包括以下步骤:

步骤1:用人14-3-3ζ基因cDNA为探针,作同源序列筛选,获得同源性90%以上的表达序列标签;然后拼接猪EST-重叠群,根据EST-重叠群序列设计基因特异性外侧引物GSP-5、GSP-3和CDS区引物CDS-F、CDS-R,其DNA序列如下所示:

GSP-5:5’ AGACGACCCTCCAAGATGACCTACGG 3’,

GSP-3:5’ TGTCTGATGATGCCCTGCTTCCTTTGC 3’,

CDS-F:5’ CCCAGAGACTGCTGAACCC 3’,

CDS-R:5’ GTGGGACAGCATGGATGACA 3’;

以成年梅山猪肌肉组织中提取总RNA为模板,进行扩增、产物纯化和克隆测序,通过序列拼接获得如序列表SEQ ID NO:1所述的猪14-3-3ζ基因片段的cDNA序列;

步骤2:利用步骤1获得的猪14-3-3ζ基因片段cDNA序列比对人14-3-3ζ基因的基因组DNA,初步推测猪14-3-3ζ基因片段的结构,在第5至第7个内含子上设计引物,其DNA序列如下所示:

I5F:5’ TGCCTGATAATTGGTAT 3’,

I7R:5’ TTAGCGTGCTGTCTTTGT 3’;

以大白猪和梅山猪基因组DNA作为模版,进行扩增和克隆测序,获得如序列表SEQ IDNO:3所示的猪14-3-3ζ基因片段的核苷酸序列,其中第938bp处为T938C的碱基突变。

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