[发明专利]用于基因分型检测东南亚缺失型α地中海贫血的方法及试剂盒在审
申请号: | 201710487917.2 | 申请日: | 2017-06-23 |
公开(公告)号: | CN109112206A | 公开(公告)日: | 2019-01-01 |
发明(设计)人: | 陈治中;卿吉琳 | 申请(专利权)人: | 陈治中 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 向群 |
地址: | 530012 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 试剂盒 引物组 地中海贫血 基因分型检测 引物序列 分子生物学领域 引物 灵敏 检测 应用 安全 | ||
1.用于基因分型检测东南亚缺失型α地中海贫血的引物组,包括如下引物对:
上下游引物序列分别如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.1所示的APF/APR;
上下游引物序列分别如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示的SEAF/SEAR。
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于,所述检测指以人体血液和/或体液和/或胚胎的遗传物质和/或人体基因组DNA为模板,用所述引物组进行PCR扩增后,将所得扩增产物进行电泳即可获知结果。
3.用于快速检测东南亚缺失型α地中海贫血基因型的试剂盒,包括权利要求1所述的引物组。
4.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述快速检测指,以待测样品包括人体血液和/或体液和/或胚胎的遗传物质和/或细胞为PCR反应的模板,用所述引物组进行PCR扩增后,将所得扩增产物进行电泳即可获知结果。
5.根据权利要求2或3所述的试剂盒,其特征在于,还包括用于进行PCR和/或电泳的试剂。
6.根据权利要求2-4任一所述的试剂盒,其特征在于,所述用于进行PCR的试剂包括dNTP、DNA聚合酶、缓冲液、双蒸水、MgCl2;
所述用于进行电泳的试剂包括琼脂糖、蒸馏水、核酸染料;
所述核酸染料选自:EB、GelGreen、SYBR Green Ⅰ、GoldView、GelRed和GelGreen。
7.根据权利要求2-5任一所述的试剂盒,其特征在于,所述PCR的反应体系为:模板1~4ng/μL;各引物:0.05~1μmol/L;MgCl2浓度为1.5~5mM/L;dNTP的浓度为100~500μM/L;DNA聚合酶的浓度为1~4U/反应;
所述PCR的反应体系优选包括如下体积份数的各组分:MightyAmp Taq 0.1-1份、2×MightyAmp Buffer 10份、APF/SEAF 0.1-1份、SEAR 0.1-1份、APR 0.1-1份、模板+超纯水7-9.3份;
所述PCR的反应体系进一步优选包括如下体积份数的各组分:MightyAmp Taq 0.5份、2×MightyAmp Buffer 10份、APF/SEAF 0.5份、SEAR 0.3份、APR 0.2份、模板+超纯水8.5份;
优选的,所述引物组各引物摩尔浓度比例如下:
APF/SEAF∶SEAR∶APR=5∶3∶2;
所述PCR的反应程序为:95℃3-5分钟;以94℃15-30秒、62-66℃25~35秒、72℃35秒为1个循环,进行34个循环;72℃5分钟;12℃12秒;
所述PCR的反应程序优选为:95℃5min;以94℃30sec、64℃30sec、72℃35sec为1个循环,进行34个循环;72℃5min;12℃12sec;
所述电泳指,将所述PCR反应产物置于质量比为2~2.5%琼脂糖凝胶中,在5V/cm电压下电泳约30~35分钟;所述琼脂糖凝胶中还添加有体积比0.005%核酸染料。
8.根据权利要求4或7所述的试剂盒,其特征在于,所述模板还包括固定在固体载体上的人体血液、和/或体液、和/或基因组DNA、和/或胚胎的遗传物质;
优选地,所述模板可以选自滤纸片干血斑样品、滤纸片干羊水样品、滤纸片干浆膜腔液样品、滤纸片干关节液样品、滤纸片干唾液样品、滤纸片干基因组DNA样品、和/或滤纸片干胚胎遗传物质样品。
9.根据权利要求4或8所述的试剂盒,其特征在于,所述人体体液选自下述物质的一种或多种:羊水、胚胎绒毛组织、浆膜腔液、关节液、唾液;所述血液包括外周血、脐带血、末梢血;所述胚胎的遗传物质包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋养外胚层细胞,即囊胚细胞。
10.权利要求1所述的引物组,和/或,权利要求2-9任一所述的试剂盒在制备东南亚缺失型α地中海贫血检测试剂方面的用途,其特征在于,在标有东南亚缺失型α地中海贫血检测用途的包装内放入所述引物组,和/或,在装有所述引物组的容器上标有东南亚缺失型α地中海贫血检测用途。
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