[发明专利]一种用于检测α地中海贫血的基因芯片、扩增试剂及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201710485206.1 申请日: 2017-06-23
公开(公告)号: CN109112200A 公开(公告)日: 2019-01-01
发明(设计)人: 陈治中;卿吉琳 申请(专利权)人: 陈治中
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883
代理公司: 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 代理人: 吴泳历
地址: 530012 广西壮*** 国省代码: 广西;45
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摘要:
搜索关键词: 地中海贫血 基因芯片 扩增试剂 试剂盒 检测 分子诊断技术 杂交
【权利要求书】:

1.一种用于检测α-地中海贫血的基因芯片,其特征在于,所述芯片上固定有:

用于检测3种非缺失型α-地中海贫血基因αCSα、αQSα、αWSα所对应的探针,其碱基序列如SEQ ID NO:11-16所示;和/或

用于检测4种缺失型α-地中海贫血基因--SEA、--THAI、-α4.2和-α3.7的探针,其碱基序列如SEQ ID NO:17-20所示。

2.根据权利要求1所述的基因芯片,其特征在于,所述芯片上还固定有

阴性对照探针(NC),其碱基序列如SEQIDNO:21,

阳性对照探针(AC),其碱基序列如SEQIDNO:22,

显色体系控制探针(CC),其碱基序列如SEQIDNO:23。

3.一种用于PCR检测非缺失α-地中海非贫血基因的扩增试剂,其特征在于:包括如下核苷酸序列的引物组:

APF:SEQ ID NO.1,

APR:SEQ ID NO.2;

其扩增的特征序列与权利要求1或2所述的基因芯片中的用于检测三种非缺失型α-地中海贫血基因αCSα、αQSα、αWSα所对应的探针特异性结合;

所述扩增试剂中加入其它PCR扩增组分,通过一次PCR反应对待测样品或提取自待测样品的DNA直接进行三种非缺失α-地中海贫基因QS、CS、WS;

所述待测样品选自新鲜采集的抗凝外周血、-20℃--80℃保存未反复冻融的陈旧性抗凝外周血、培养羊水细胞、绒毛、羊水、脐带血、末梢血、DBS样本和/或类似DBS处理的样本、唾液、胚胎的遗传物质包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋养外胚层细胞,即囊胚细胞、多个细胞或单个细胞等。

4.根据权利要求3所述的扩增试剂,其特征在于,用于一个反应的所述PCR扩增试剂中,含有:

5.一种用于PCR检测缺失型α-地中海非贫血基因的扩增试剂,其特征在于:包含如下核苷酸序列的引物组:

SEAF:SEQ ID NO.3

SEAR:SEQ ID NO.4

THAIF:SEQ ID NO.5

THAIR:SEQ ID NO.6

4.2F:SEQ ID NO.7

4.2R:SEQ ID NO.8

3.7F:SEQ ID NO.9

3.7R:SEQ ID NO.10

其扩增的特征序列与权利要求1或2所述的基因芯片中的用于检测四种缺失型α-地中海贫血基因--SEA、--THAI、-α4.2和-α3.7所对应的探针特异性结合;

所述扩增试剂中加入其它PCR扩增组分,通过一次PCR反应对待测样品或提取自待测样品的DNA直接进行4种缺失α-地中海贫基因--SEA、--THAI、-α4.2和-α3.7-地中海贫血基因的检测,所述待测样品选自新鲜采集的抗凝外周血、-20℃--80℃保存未反复冻融的陈旧性抗凝外周血、培养羊水细胞、绒毛、羊水、脐带血、末梢血、DBS样本和/或类似DBS处理的样本、唾液、胚胎的遗传物质包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋养外胚层细胞,即囊胚细胞、多个细胞或单个细胞等。

6.根据权利要求5所述的扩增试剂,其特征在于,用于一个反应的所述PCR扩增试剂中,含有:

7.根据权利要求5或6所述的扩增试剂,其特征在于,所述引物组各引物摩尔浓度比例如下:

优选的,用于一个反应的所述PCR扩增试剂中,含有:

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