[发明专利]一种用于快速检测泰国型α-地中海贫血的PCR扩增引物组、扩增试剂及试剂盒在审
申请号: | 201710484621.5 | 申请日: | 2017-06-23 |
公开(公告)号: | CN109112196A | 公开(公告)日: | 2019-01-01 |
发明(设计)人: | 陈治中 | 申请(专利权)人: | 陈治中 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 吴泳历 |
地址: | 530012 广西壮*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 地中海贫血 检测 核酸提取 检测结果 检测试剂 快速检测 扩增试剂 试剂盒 分子诊断技术 降解 灵敏 污染 应用 安全 | ||
1.一种用于快速检测泰国型α-地中海贫血的PCR扩增引物组,其特征在于:包含如SEQID NO.2和SEQ ID NO.3所示的上下游引物THAIF/THAIR,用于扩增α-珠蛋白基因簇中--THAI等位基因,PCR扩增特征片段为478bp;
所述PCR扩增引物组可直接以待测样品和/或自待测样品提取的DNA为模板进行扩增;
所述待测样品选自新鲜采集的抗凝外周血、-20℃--80℃保存未反复冻融的陈旧性抗凝外周血、培养羊水细胞、绒毛、羊水、脐带血、末梢血、唾液、DBS样本和/或类似DBS处理的样本、胚胎的遗传物质包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋养外胚层细胞,即囊胚细胞。
2.根据权利要求1所述的PCR扩增引物组,其特征在于:还包含SEQ ID NO.1所示的引物;
其中SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.3分别作为上、下游引物APF/APR用于扩增α-珠蛋白基因簇中正常人基因,PCR扩增特征片段为317bp。
3.根据权利要求2所述的PCR扩增引物组,其特征在于:引物组中三条引物混合在一起,SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3的摩尔浓度比例为2:3:5。
4.一种用于快速检测泰国型α-地中海贫血的PCR扩增试剂,其特征在于,用于一个反应的所述PCR扩增试剂中,含有:
其中所述引物THAIF如SEQ ID NO.2所示,所述引物THAIR如SEQ ID NO.3 所示,所述引物APF如SEQ ID NO.1所示,
所述PCR扩增试剂适合直接加入蒸馏水和待测样品和/或自待测样品提取的DNA达到20份体积进行扩增;
所述待测样品选自新鲜采集的抗凝外周血、-20℃--80℃保存未反复冻融的陈旧性抗凝外周血、培养羊水细胞、绒毛、羊水、脐带血、末梢血、唾液、DBS样本和/或类似DBS处理的样本、多个细胞或单个细胞、胚胎的遗传物质包括配子如精子或卵子、卵裂期胚胎的卵裂球、囊胚滋养外胚层细胞,即囊胚细胞。
5.根据权利要求4所述的PCR扩增试剂,其特征在于,其中三条引物SEQ ID NO.1、SEQID NO.2和SEQ ID NO.3的摩尔浓度比例为2:3:5。
6.根据权利要求5所述的PCR扩增试剂,其特征在于,用于一个反应的所述PCR扩增试剂中,含有:
7.一种用于快速检测泰国型α-地中海贫血的试剂盒,包含权利要求1-3任一所述的引物组以PCR扩增所需的常规试剂;所述常规试剂包括缓冲液、DNA扩增酶、MgCl2和dNTPs。
8.一种快速检测泰国型α-地中海贫血的方法,其特征在于,采用权利要求1-3任一所述的引物组或权利要求4-7任一所述的PCR扩增试剂对待测样品进行PCR扩增;包括如下步骤:
(1)准备待测样品,
(2)准备PCR扩增体系,
(3)运行PCR程序并检测扩增产物;
只得到一条带317bp条带时,结果初步判断为正常型;
得到478bp和317bp两条带时结果初步判断为携带--THAI等位基因;
仅得到一条478bp条带时,结果初步判断为--THAI等位基因纯合子;
所述待测样品选自新鲜采集的抗凝外周血、-20℃--80℃保存未反复冻融的陈旧性抗凝外周血、培养羊水细胞、绒毛、羊水、脐带血、末梢血、DBS样本和/或类似DBS处理的样本、多个细胞或单个细胞。
9.根据权利要求4-7任一所述的方法,其特征在于:所述PCR程序95℃预变性3~5分钟,然后94℃15~30秒,62-66℃退火25~35秒,28~38个循环。
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