[发明专利]水稻杂种花粉育性基因座Sc的等位基因Sc‑j和Sc‑i的分离克隆和在育种中的应用在审
| 申请号： | 201710476748.2 | 申请日： | 2017-06-21 |
| 公开（公告）号： | CN107164390A | 公开（公告）日： | 2017-09-15 |
| 发明（设计）人： | 刘耀光 | 申请（专利权）人： | 华南农业大学 |
| 主分类号： | C12N15/29 | 分类号： | C12N15/29;C07K14/415;C12N15/82;A01H5/00;A01H1/02 |
| 代理公司： | 广州粤高专利商标代理有限公司44102 | 代理人： | 单香杰 |
| 地址： | 510642 广*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 水稻 杂种 花粉 基因 sc 等位基因 分离 克隆 育种 中的 应用 | ||
1.水稻杂种花粉育性基因座Sc的控制花粉育性的等位基因，其特征在于，包括粳稻中的单拷贝等位基因Sc-j ，其核苷酸序列如SEQ ID NO: 1所示；和籼稻中的串联重复拷贝等位基因Sc-ia和Sc-ib，Sc-ia和Sc-ib的核苷酸序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO: 3所示。
2.根据权利要求1所述的等位基因，其特征在于，等位基因Sc-j编码的蛋白序列如SEQ ID NO: 4所示，等位基因Sc-ia编码的蛋白序列如SEQ ID NO:5， 等位基因Sc-ib编码的蛋白序列如SEQ ID NO: 6所示。
3.一种培育水稻杂种育性亲和系的方法，其特征在于，利用基因组编辑技术，将含有Sc-i等位基因的水稻品种中的Sc-ia或/和Sc-ib部分基因拷贝定点突变，降低Sc-i基因座的活性基因拷贝数，产生杂种亲和系。
4.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，对于含有Sc-ia、Sc-ib1和Sc-ib2的水稻品种，利用基因组编辑技术将Sc-ia、Sc-ib1或Sc-ib2中的任意一个或任意两个基因拷贝进行定点突变，降低Sc-i基因座的活性基因拷贝数，产生杂种亲和系，Sc-ib1和Sc-ib2的核苷酸序列同Sc-ib，Sc-ib1和Sc-ib2是Sc-ib的两个基因拷贝的命名。
5.根据权利要求3所述的方法，其特征在于，对于含有Sc-ib1和Sc-ib2的水稻品种，利用基因组编辑技术将Sc-ib1或Sc-ib2中的任意一个基因拷贝进行定点突变，降低Sc-i基因座的活性基因拷贝数，产生杂种亲和系，Sc-ib1和Sc-ib2的核苷酸序列同Sc-ib，Sc-ib1和Sc-ib2是Sc-ib的两个基因拷贝的命名。
6.根据权利要求3至5任一项所述的方法，其特征在于，通过如下步骤制备得到：
S1.利用Sc-ib基因编码区第235位的G碱基变异，设计一个对Sc-ib基因特异的CRISPR/Cas9基因编辑靶点，构建表达此特异靶点sgRNA的 CRISPR/Cas9载体；
S2.以此基因修饰载体转化含有Sc-i重复拷贝等位基因的水稻品种，获得Sc-ib等位基因特异性突变，而Sc-ia等位基因为野生型的突变体。
7.权利要求3至6任一项所述的培育水稻杂种育性亲和系的方法在水稻杂交育种中的应用，其特征在于：将权利要求3至6任一项所述方法培育得到的水稻杂种育性亲和系和粳稻品种杂交，培育Sc座位不产生花粉败育的杂种，用于水稻杂交育种。
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