[发明专利]与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.可识别或扩增与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL位点紧密连锁的SNP分子标记的分子探针或引物对，所述分子标记为分子标记26139或分子标记13328，定位于中国南瓜19号连锁群上，分别位于蔗糖/葡萄糖基因两侧；其中，分子标记26139包含SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列或其同源SNP序列，SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第260位碱基是SNP位点，其碱基为G或C；分子标记13328包含SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列或其同源SNP序列，SEQ ID NO.2所示序列自5’端起第25位碱基是SNP位点，其碱基为A或C。

2.根据权利要求1所述的分子探针或引物对，其特征在于：引物对为dCAPS引物对。

3.根据权利要求2所述的分子探针或引物对，其特征在于：用于检测分子标记26139的dCAPS引物对的核苷酸序列如下所示：

F1 ：5’- TCGAATCCTGTTTCTGTTTGAAT -3’ (SEQ ID NO.3)，

R1 ：5’- TATGGTATAATGAAATGGCCGCT -3’（SEQ ID NO.4），

其对应的限制性核酸内切酶为BsrBI。

4.根据权利要求2所述的分子探针或引物对，其特征在于：用于检测分子标记13328的dCAPS引物对的核苷酸序列如下所示：

F1 ：5’- GAAGTGTTGGAACTCAAACATCTG -3’ (SEQ ID NO.5)，

R1 ：5’- TCCCTTATTGGTGTTCTTCTGAAC -3’（SEQ ID NO.6），

其对应的限制性核酸内切酶为Hpy188I。

5.识别或检测与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL位点紧密连锁的SNP分子标记的分子探针或引物对在选育高蔗糖/葡萄糖比值辅助育种中的应用，所述分子标记为分子标记26139或分子标记13328，定位于中国南瓜19号连锁群上，分别位于蔗糖/葡萄糖基因两侧；其中，分子标记26139包含SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列或其同源SNP序列，SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第260位碱基是SNP位点，其碱基为G或C；分子标记13328包含SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列或其同源SNP序列，SEQ ID NO.2所示序列自5’端起第25位碱基是SNP位点，其碱基为A或C。

6.一种用于南瓜高蔗糖/葡萄糖比值辅助育种的试剂盒，其包括识别或扩增与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL位点紧密连锁的SNP分子标记的分子探针或引物对，所述分子标记为分子标记26139或分子标记13328，定位于中国南瓜19号连锁群上，分别位于蔗糖/葡萄糖基因两侧；其中，分子标记26139包含SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列或其同源SNP序列，SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第260位碱基是SNP位点，其碱基为G或C；分子标记13328包含SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列或其同源SNP序列，SEQ ID NO.2所示序列自5’端起第25位碱基是SNP位点，其碱基为A或C。

7.一种南瓜辅助育种的方法，包括提取南瓜基因组DNA，检测与南瓜蔗糖/葡萄糖比值主效QTL位点紧密连锁的SNP分子标记的类型，根据SNP类型确定南瓜品种蔗糖/葡萄糖比值高低，其中，所述分子标记为分子标记26139或分子标记13328，定位于中国南瓜19号连锁群上，分别位于蔗糖/葡萄糖基因两侧；其中，分子标记26139包含SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列或其同源SNP序列，SEQ ID NO.1所示序列自5’端起第260位碱基是SNP位点，其碱基为G或C；分子标记13328包含SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列或其同源SNP序列，SEQ ID NO.2所示序列自5’端起第25位碱基是SNP位点，其碱基为A或C。