[发明专利]一种酿酒糯高粱常规种品种或种质纯度鉴定的方法

说明书

本发明属于分子生物学领域，涉及一种酿酒高粱常规种品种和种质纯度鉴定的方法，该方法依据基因组简单序列重复标记(SSR，Simple Sequence Repeats)的基本原理，根据数据库提供信息合成特异性标记引物，利用提取的高粱品种DNA扩增并筛选分子标记位点，最终获得“红缨子”等酿酒高粱品种基因组特异性条带。根据高粱品种特异性条带图谱取样分析并进行统计，可以鉴定酒厂原料的种质纯度。该方法操作简便、效果明显、可行性高。

技术领域

本发明属分子生物学技术领域，具体涉及一种基因组分子标记技术鉴定酿酒高粱原料的应用研究，该发明涉及方法可用于不同酿酒高粱品种和种质纯度的鉴定。

背景技术

随着中国白酒酿造行业的深度调整，酿酒专用高粱发展迅速。近年来酱香酒高粱原料的需求量很大，其中贵州省的“红缨子”高粱推广面积最大。如何判断专用高粱种质的真伪是酒厂实际原料收购中需要面对的一个重要问题。以往酒厂的原料鉴定常常根据理化指标含量(如总淀粉、支链淀粉、单宁含量等)来判定种质真伪，这种鉴定方法具有工作量较大，耗时长，鉴定灵敏度不高等因素的局限。

高粱是二倍体作物，基因组共10对染色体。高粱基因组上均匀分布着一类短的串联重复序列，根据这些串联重复序列两侧保守位点设计引物进行PCR扩增并电泳分析或测序，可以进行种质鉴定或遗传多样性分析，这是简单序列重复标记(SSR，Simple SequenceRepeats)或微卫星(Microsatellite)标记的基本原理。通过分子标记技术构建不同酿酒高粱品种的DNA指纹图谱，可以发掘高粱品种基因组特异位点的多态性特征，为实际的原料品种来源的鉴定提供依据。目前高粱基因组已开发出大量的SSR分子标记(http://archive.gramene.org/cmap/)，利用这种分子标记技术可以有效地解决争议，判定高粱种质真伪。然而我国高粱常规种遗传基础比较狭窄，以红缨子为代表的高粱常规种部分基因组位点间相似性很高，大部分扩增出的SSR分子标记位点条带大小很相似，因此怎样筛选出鉴定品种所对应的特异性SSR标记，是本发明的一个重点，也是一个难点。目前，还没有关于酿酒高粱尤其是酱香酒用糯高粱种质分子标记技术鉴定方法的报道。综上所述，对于酿酒高粱种质的鉴定，亟待找到合适的SSR位点以及引物，鉴定尽可能多的高粱种质类别。

发明内容

本发明的目的在于提供一组高粱的SSR分子标记位点用于高粱品种或种质纯度的鉴定。

本发明的目的在于还提供一组引物，用于鉴定高粱品种或种质纯度。

本发明的目的还在于提供一种高效、灵敏、应用范围广的高粱品种和种质纯度的鉴定方法。

一方面，本发明提供了高粱的SSR分子标记位点txp36和txp287在鉴定高粱品种/种质纯度中的应用

另一方面，本发明提供了高粱SSR分子标记位点的引物组，其包含两对SSR引物：

1)txp36位点的引物，作为优选的实施方式，其由SEQ.ID NO.1所示的左引物和SEQ.ID NO.2所示的右引物组成；；

2)txp287位点的引物，作为优选的实施方式，其由SEQ.ID NO.3所示的左引物和SEQ.ID NO.4所示的右引物组成；。

另一方面，本发明还提供了上述位点以及引物组在高粱品种鉴定或者是种质纯度鉴定中的应用。

作为优选的实施方式，本发明的引物组或者应用，其中，待鉴定的高粱品种为酿酒高粱，其中主要为酿酒糯高粱；或者，作为优选的实施方式，鉴定的高粱品种为红缨子、黔高7号、黔高8号、泸州红1号、国窖红1号、晋杂22号、晋杂23号、晋杂35号、晋杂103号、晋杂104号、晋糯3号、两糯1号、辽粘3号、辽杂15号、辽杂18号、辽杂19号和辽杂37号中的一种或多种；更优选红缨子、黔高7号、辽杂37号；尤其优选的是红缨子，因为红缨子的推广面积在贵州最大，且为主要的专用酿酒品种，其鉴定具有重要的意义。