[发明专利]CRISPR/SaCas9特异性敲除人CXCR4基因的方法在审
申请号: | 201710444953.0 | 申请日: | 2017-06-12 |
公开(公告)号: | CN107236739A | 公开(公告)日: | 2017-10-10 |
发明(设计)人: | 杨通;刘佩;欧恩智;陈珺;朱智 | 申请(专利权)人: | 上海捷易生物科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N9/22;C12N15/90;C12N15/864 |
代理公司: | 上海沪慧律师事务所31311 | 代理人: | 朱九皋 |
地址: | 201201 上海市浦东新区中国(*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | crispr sacas9 特异性 cxcr4 基因 方法 | ||
1.用于特异性靶向人CXCR4基因的sgRNA,其特征在于,所述sgRNA的靶序列为SEQ ID NO:1~4所示序列中的任意一条序列。
2.根据权利要求1所述的用于特异性靶向人CXCR4基因的sgRNA,其特征在于,所述sgRNA的靶序列如SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示。
3.CRISPR/SaCas9特异性敲除人CXCR4基因的方法,该方法用于非诊断和治疗目的,其特征在于,步骤包括:
1)在权利要求1或2所述的sgRNA的靶序列的5’端加上用于形成粘性末端的序列,得到正向寡核苷酸;在权利要求1或2所述的sgRNA的靶序列的互补链的两端加上用于形成粘性末端的序列,得到反向寡核苷酸;合成所述正向寡核苷酸和反向寡核苷酸,变性、退火,形成带有粘性末端的双链sgRNA寡聚核苷酸;
2)线性化腺相关病毒载体AAV-CRISPR/SaCas9,将所述双链sgRNA寡聚核苷酸连入线性化的AAV-CRISPR/SaCas9载体,转化感受态细胞,筛选获得阳性克隆,摇菌,抽提质粒;
3)将步骤2)提取的含有所述双链sgRNA寡聚核苷酸的AAV-CRISPR/SaCas9载体包装成腺相关病毒;
4)用步骤3)包装的腺相关病毒感染目的细胞,培养,收集被感染的目的细胞,进行酶切检测和克隆测序,确定CXCR4基因的敲除效率,并获得基因敲除的细胞。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤1),在所述靶序列的5’端加上CACCG得到正向寡核苷酸;在所述靶序列的互补链的5’端加上AAAC,3’端加上C,得到反向寡核苷酸。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述正向寡核苷酸的序列如SEQ ID NO:5所示,所述反向寡核苷酸的序列如SEQ ID NO:6所示。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述正向寡核苷酸的序列如SEQ ID NO:7所示,所述反向寡核苷酸的序列SEQ ID NO:8所示。
7.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤1),所述双链sgRNA寡聚核苷酸带有BsaI酶切位点;步骤2),用BsaI核酸内切酶切割AAV-CRISPR/SaCas9载体,使所述载体线性化。
8.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤2),所述感受态细胞为DH5α感受态细胞;步骤4),所述目的细胞为HEK-293T细胞,所述酶切检测为T7E1酶切检测,所述克隆测序为TA克隆测序。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤4),T7E1酶切检测中使用的PCR扩增引物对的序列如SEQ ID NO:13~14所示。
10.特异性敲除人CXCR4基因的CRISPR/SaCas9系统,其特征在于,所述CRISPR/SaCas9系统包含有权利要求1或2所述的特异性靶向人CXCR4基因的sgRNA。
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