[发明专利]一种胃癌分子标志物hsa_circ_0006633及其应用有效
申请号: | 201710392092.6 | 申请日: | 2017-05-27 |
公开(公告)号: | CN107177669B | 公开(公告)日: | 2020-11-06 |
发明(设计)人: | 叶国良;陆蓉丹;郭俊明;陆佳敏;邵永富 | 申请(专利权)人: | 叶国良 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 上海泰能知识产权代理事务所 31233 | 代理人: | 黄志达 |
地址: | 315000 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 胃癌 分子 标志 hsa_circ_0006633 及其 应用 | ||
本发明涉及一种胃癌分子标志物hsa_circ_0006633及其应用,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,为一种闭合环状RNA分子标志物,在胃癌组织中显著低表达,具有极好的胃癌相关性。本发明通过circRNA芯片、实时荧光定量PCR检测等技术,结合简便、经济、实用的特点,探究circRNA作为胃癌筛查标志物的可行性,在临床诊断及应用中具有重要的意义。
技术领域
本发明属于肿瘤标志物及应用领域,特别涉及一种胃癌分子标志物hsa_circ_0006633及其应用。
背景技术
胃癌是世界上最常见的肿瘤之一,每年死于胃癌的人数占了全球死亡人数的10.4%,列肿瘤死亡原因的第三位。胃癌具有起病隐匿、早期易漏诊、易转移与复发等特点,且我国受到经济及医疗条件等多方面制约,早期胃癌的诊断率不足10%,患者被诊断时往往已经处于胃癌进展期,其5年生存率约4~27%。当前胃镜活检及其病理结果作为诊断胃癌的金标准,因其高费用和操作的有创性使其在早期胃癌的筛查过程中受到了很大的限制。同时X线钡餐造影、腹部CT、腹部MRI等检查方法则缺少较高的灵敏度。尽管血清肿瘤标志物(如癌胚抗原、CA19-9)的检测在临床上得到广泛的应用,但由于其均为非特异性的肿瘤相关抗原,灵敏度及特异度均有一定的局限性。
环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类由5'末端和3'末端反向共价连接形成环形结构的非编码RNA分子。随着RNA测序和生物信息学的快速发展,人们发现circRNA大量存在于真核细胞中。因circRNA具有丰富性、稳定性、保守性等特点,具有一定的组织、时序和疾病特异性,其成为近年研究的新热点。越来越多的研究表明,circRNA作为一类具有重要调控功能的生物分子,与肿瘤的发生、发展、侵袭、转移及患者预后都有密切关系。
鉴于胃癌的发生发展是一个多因素、多阶段、多步骤的过程,涉及到大量的基因参与及复杂的网络调控,胃癌的病理生理机制迄今尚未完全阐明,对于其早期诊断及进一步治疗有极大的限制。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种胃癌分子标志物hsa_circ_0006633及其应用,本发明首先设计能扩增hsa_circ_0006633的特异性PCR反向引物,通过PCR产物测序的方法证实了引物扩增的特异性和胃癌组织hsa_circ_0006633的存在性;并通过qRT-PCR方法大样本验证hsa_circ_0006633在不同阶段胃组织中的水平及变化规律,证明hsa_circ_0006633具有较好的胃癌相关性;通过构建ROC曲线明确了胃癌组织hsa_circ_0006633的胃癌临床诊断价值;结合肿瘤临床病理因素,明确了胃癌组织hsa_circ_0006633表达水平与肿瘤临床病理因素的联系。本发明发现的胃癌组织中特异性表达下调hsa_circ_0006633具有作为新型胃癌筛查分子标志物的潜质。
本发明的一种胃癌分子标志物hsa_circ_0006633,其核苷酸序列为AAAGTTGTACAAGGGATTGATTTAAACCAAATTCGAGGACTTGGGTTTGATGCCACGTGTTCTCTGGTTGTTTTGGATAAGCAGTTTCACCCATTACCAGTCAACCAGGAAGGGGATTCCCATCGAAACGTCATCATGTGGCTGGACCATCGAGCAGTCAGTCAAGTTAACAGGATCAATGAGACCAAGCACAGTGTCCTCCAGTACGTCGGGGGGGTGATGTCTGTGGAAATGCAGGCCCCGAAACTTCTGTGGCTGAAAGAGAACTTGAGAGAGATTTGCTGGGATAAGGCGGGACATTTCTTTGATCTCCCGGACTTCTTATCGTGGAAGGCAACAGGTGTCACAGCACG如SEQ ID NO.1所示。
所述胃癌分子标志物为环状RNA hsa_circ_0006633,定位人类1号染色体59805629~59844509区域,由FGGY基因转录后经剪切形成。
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